156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2728 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  70.79 
 
 		 214 aa  298  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  66.83 
 
 		 214 aa  289  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  65.17 
 
 		 211 aa  284  9e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  63.24 
 
 		 216 aa  283  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  65.02 
 
 		 211 aa  282  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  65.17 
 
 		 211 aa  277  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  65.33 
 
 		 206 aa  277  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  65.33 
 
 		 206 aa  277  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  62.69 
 
 		 216 aa  275  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  60.49 
 
 		 216 aa  274  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  65.17 
 
 		 212 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  60 
 
 		 216 aa  269  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  61.76 
 
 		 211 aa  265  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  64.47 
 
 		 211 aa  259  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  62.69 
 
 		 208 aa  260  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  60.09 
 
 		 215 aa  258  6e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  58.17 
 
 		 218 aa  254  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  57.21 
 
 		 218 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  60.1 
 
 		 218 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  59.62 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  59.62 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  58.91 
 
 		 214 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  58.91 
 
 		 214 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  58.91 
 
 		 214 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  58.91 
 
 		 223 aa  246  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  57.35 
 
 		 213 aa  240  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  57.69 
 
 		 217 aa  240  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  55.24 
 
 		 232 aa  239  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  58.08 
 
 		 235 aa  238  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  57.14 
 
 		 214 aa  238  5e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  56.93 
 
 		 214 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  57 
 
 		 202 aa  237  8e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  56.99 
 
 		 212 aa  236  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  54.37 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  54.9 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  57.07 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  56.52 
 
 		 211 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  56.59 
 
 		 216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  56.44 
 
 		 221 aa  232  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  55.45 
 
 		 211 aa  231  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  53.4 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  54.95 
 
 		 211 aa  228  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  55 
 
 		 205 aa  227  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  56.5 
 
 		 205 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  55.61 
 
 		 199 aa  221  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  52.48 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  52 
 
 		 217 aa  215  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  53.5 
 
 		 238 aa  214  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  57.89 
 
 		 179 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  37 
 
 		 243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  37.75 
 
 		 251 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  39.3 
 
 		 244 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  37.75 
 
 		 251 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  37.89 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  36.67 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  37.76 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  37.88 
 
 		 270 aa  122  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  33.33 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  36.08 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  35.08 
 
 		 269 aa  118  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  36.08 
 
 		 277 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  33.17 
 
 		 251 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  33.17 
 
 		 251 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  36.36 
 
 		 274 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  33.17 
 
 		 251 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  34.87 
 
 		 270 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  33.5 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  32.49 
 
 		 279 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  33.17 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  32.37 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  33.17 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  32.54 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  34.83 
 
 		 245 aa  111  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  32.84 
 
 		 280 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  34.03 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  31.53 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  34.92 
 
 		 274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  31.68 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  34.33 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  34.38 
 
 		 273 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  35.45 
 
 		 204 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  34.72 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  32.18 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  33.33 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  33.16 
 
 		 280 aa  101  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  36.13 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  32.35 
 
 		 268 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  32.84 
 
 		 276 aa  99.8  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  31.31 
 
 		 241 aa  99  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  30.96 
 
 		 241 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  33.17 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  31.71 
 
 		 244 aa  95.5  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  34.55 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  31.31 
 
 		 238 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  33.89 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  34.55 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  32.29 
 
 		 198 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  32.5 
 
 		 195 aa  91.7  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>