117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3790 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  567  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  72.14 
 
 		 268 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  63.75 
 
 		 257 aa  328  8e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  50.65 
 
 		 244 aa  231  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  48.25 
 
 		 244 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  44.74 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  47.08 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  48.31 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  47.88 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  47.88 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  47.08 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  44.1 
 
 		 242 aa  204  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  42.48 
 
 		 248 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  43.1 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  42.92 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  44.4 
 
 		 241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  42.92 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  39.32 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  41.35 
 
 		 243 aa  191  8e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  40.95 
 
 		 235 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  43.78 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  34.48 
 
 		 245 aa  178  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  42.06 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  36.51 
 
 		 243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  40.77 
 
 		 270 aa  162  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  36.19 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  40.17 
 
 		 270 aa  158  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  38.98 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  33.95 
 
 		 279 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  37.71 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  35.11 
 
 		 245 aa  151  8.999999999999999e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  36.21 
 
 		 280 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  36 
 
 		 239 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  36.96 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  36.44 
 
 		 275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  37.24 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  37.95 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  37.95 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  36.14 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  34.69 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  36.89 
 
 		 277 aa  129  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3726  urea carboxylase-associated protein 2  36.25 
 
 		 281 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  32.4 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2729  hypothetical protein  35.71 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3667  hypothetical protein  34.33 
 
 		 300 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1838  hypothetical protein  32.2 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1885  hypothetical protein  32.2 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  33.06 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  32.2 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  29.52 
 
 		 214 aa  102  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  33.02 
 
 		 216 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  30.57 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  28.37 
 
 		 211 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  32.84 
 
 		 210 aa  99.8  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  30.54 
 
 		 218 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  30.85 
 
 		 215 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  29.67 
 
 		 211 aa  97.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  30.73 
 
 		 223 aa  95.9  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  29.15 
 
 		 211 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  30.54 
 
 		 218 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  28.77 
 
 		 232 aa  93.6  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  31.13 
 
 		 214 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  31.13 
 
 		 214 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  31.13 
 
 		 214 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  27.32 
 
 		 211 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  26.96 
 
 		 214 aa  92.4  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  26.15 
 
 		 216 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  26.4 
 
 		 211 aa  90.1  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  29.95 
 
 		 214 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  28.37 
 
 		 214 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  28.3 
 
 		 212 aa  89.7  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  30.09 
 
 		 218 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  27.96 
 
 		 211 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  29.63 
 
 		 218 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  29.63 
 
 		 218 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  30.37 
 
 		 217 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  25.76 
 
 		 216 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  32.66 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  28.16 
 
 		 206 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  28.16 
 
 		 206 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  28.14 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  31.16 
 
 		 235 aa  87  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  29.65 
 
 		 211 aa  86.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  28.43 
 
 		 212 aa  85.9  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  30.3 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  31.1 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  27.84 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  28.17 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  28.02 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  27.08 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  28.57 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  28.71 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  26.67 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  26.5 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  28.14 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  26.79 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  25.62 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  28.06 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  27.87 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  27.32 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>