128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4241 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  95.44 
 
 		 241 aa  477  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  85.89 
 
 		 241 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  72.2 
 
 		 242 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  69.17 
 
 		 248 aa  357  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  71.93 
 
 		 235 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  69.75 
 
 		 248 aa  352  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  52.4 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  50.67 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  47.81 
 
 		 245 aa  229  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  48.5 
 
 		 251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  46.9 
 
 		 257 aa  224  6e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  46.72 
 
 		 243 aa  224  8e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  47.64 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  49.78 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  45.73 
 
 		 251 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  45.73 
 
 		 251 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  45.73 
 
 		 251 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  46.02 
 
 		 245 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  42.92 
 
 		 276 aa  200  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  43.64 
 
 		 239 aa  190  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  42.98 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  42.06 
 
 		 243 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  39.74 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  40.81 
 
 		 275 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  39.13 
 
 		 273 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  39.13 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  38.01 
 
 		 244 aa  151  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  37.99 
 
 		 278 aa  151  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  36.21 
 
 		 270 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  37.44 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  37 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  37.44 
 
 		 277 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  36.52 
 
 		 270 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  36.97 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  38.43 
 
 		 274 aa  142  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  35.68 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  34.36 
 
 		 279 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  34.36 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  34.82 
 
 		 280 aa  118  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2729  hypothetical protein  32.33 
 
 		 260 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  34.65 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3726  urea carboxylase-associated protein 2  34.21 
 
 		 281 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  32.55 
 
 		 211 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1838  hypothetical protein  33.05 
 
 		 307 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1885  hypothetical protein  33.05 
 
 		 307 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  30.5 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  32.84 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  31.06 
 
 		 287 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  35.45 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  32.62 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  29.44 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  26.36 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  28.88 
 
 		 212 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3667  hypothetical protein  33.15 
 
 		 300 aa  98.6  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  27.37 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  30.96 
 
 		 210 aa  98.2  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  32.59 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  30.5 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  26.5 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  29.33 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  27.78 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  30.5 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  32.07 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  27.41 
 
 		 214 aa  95.5  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  32.24 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  25.59 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  25.59 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  32.26 
 
 		 217 aa  93.2  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  31.94 
 
 		 218 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  31.94 
 
 		 218 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  33.16 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  31.94 
 
 		 218 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  30.05 
 
 		 202 aa  91.7  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  24.88 
 
 		 216 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  29.49 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  29.13 
 
 		 214 aa  90.9  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  30.99 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  30.3 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  26.04 
 
 		 211 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  30.65 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  29.59 
 
 		 213 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  29.26 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  30.65 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  25.26 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  29 
 
 		 205 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  29.57 
 
 		 205 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  28.93 
 
 		 217 aa  86.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  28.34 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  28.34 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  28.34 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  29.67 
 
 		 207 aa  81.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  27 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  26.6 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  26.74 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  26.09 
 
 		 208 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  27.47 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  29.35 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.987033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  28.18 
 
 		 211 aa  72  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  27.32 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>