145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1224 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  551  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  71.04 
 
 
270 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  71.04 
 
 
269 aa  377  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  71.81 
 
 
270 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  59.11 
 
 
279 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  60.97 
 
 
280 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  60.97 
 
 
277 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  60.31 
 
 
275 aa  324  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  63.32 
 
 
273 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  62.16 
 
 
273 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  54.62 
 
 
270 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  50.39 
 
 
278 aa  250  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  46.15 
 
 
243 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2729  hypothetical protein  48.09 
 
 
260 aa  185  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  43.83 
 
 
244 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  40.77 
 
 
244 aa  175  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  40.61 
 
 
235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  43.38 
 
 
274 aa  171  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  43.97 
 
 
274 aa  168  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  38.43 
 
 
257 aa  166  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  39.57 
 
 
242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  39.69 
 
 
280 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  42.11 
 
 
251 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  41.67 
 
 
251 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  41.67 
 
 
251 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  39.04 
 
 
257 aa  155  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  39.38 
 
 
241 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  39.18 
 
 
251 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  39.51 
 
 
251 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  36.64 
 
 
245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  37.39 
 
 
241 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  35.84 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  36.96 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  35.84 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  36.52 
 
 
241 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  36.23 
 
 
211 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3667  hypothetical protein  39.7 
 
 
300 aa  142  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1838  hypothetical protein  41.75 
 
 
307 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1885  hypothetical protein  41.75 
 
 
307 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  39.04 
 
 
268 aa  141  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  38.1 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  41 
 
 
287 aa  139  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  32.16 
 
 
245 aa  138  8.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  40.72 
 
 
307 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  37.3 
 
 
212 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  35.42 
 
 
211 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  36.29 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  36.47 
 
 
277 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  33.48 
 
 
245 aa  132  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  36.61 
 
 
206 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  36.61 
 
 
206 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  37.02 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  34.21 
 
 
211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  35.98 
 
 
214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  38.05 
 
 
217 aa  129  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  37 
 
 
213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  33.51 
 
 
216 aa  125  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  36.18 
 
 
208 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  35.35 
 
 
214 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  35.03 
 
 
216 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  33.65 
 
 
232 aa  123  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  33.33 
 
 
216 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  33.82 
 
 
215 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  31.4 
 
 
214 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  36.24 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  33.33 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  37.44 
 
 
205 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  36.08 
 
 
210 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  36.08 
 
 
229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3726  urea carboxylase-associated protein 2  34.06 
 
 
281 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  36.41 
 
 
205 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  36.65 
 
 
211 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  33.67 
 
 
211 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  34.5 
 
 
244 aa  115  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  31.86 
 
 
214 aa  113  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  35.26 
 
 
235 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  34.31 
 
 
219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  33.66 
 
 
211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  33.5 
 
 
211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  34.87 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  33.87 
 
 
207 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  33.85 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  31.68 
 
 
212 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  32.5 
 
 
223 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  33.5 
 
 
211 aa  106  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  32 
 
 
214 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  32 
 
 
214 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  32 
 
 
214 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  32.84 
 
 
218 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  32.68 
 
 
211 aa  105  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  32.84 
 
 
218 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  32.84 
 
 
218 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  31.22 
 
 
212 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  32.82 
 
 
217 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  32.45 
 
 
202 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  30.54 
 
 
224 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  32.8 
 
 
199 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  35.88 
 
 
179 aa  99.8  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  29.31 
 
 
238 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  29.19 
 
 
221 aa  92  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>