136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2683 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  100 
 
 		 248 aa  521  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  92.34 
 
 		 248 aa  479  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  76.37 
 
 		 242 aa  384  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  70.17 
 
 		 241 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  69.75 
 
 		 241 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  71.43 
 
 		 241 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  67.81 
 
 		 235 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  52.84 
 
 		 244 aa  251  7e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  46.96 
 
 		 257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  44.98 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  48.21 
 
 		 245 aa  229  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  47.16 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  48.46 
 
 		 244 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  45.73 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  44.87 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  42.48 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  44.59 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  45.37 
 
 		 245 aa  203  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  44.16 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  44.16 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  41.15 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  43.1 
 
 		 245 aa  188  7e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  40.53 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  40.62 
 
 		 273 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  40.62 
 
 		 273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  40.36 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  38.5 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  37.84 
 
 		 244 aa  156  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  38.57 
 
 		 275 aa  155  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  37.67 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  36.77 
 
 		 269 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  36.61 
 
 		 270 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  36.77 
 
 		 270 aa  151  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  36.77 
 
 		 270 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  36.77 
 
 		 280 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  35.84 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  38.05 
 
 		 278 aa  145  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  37.61 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  37.02 
 
 		 274 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  28.44 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  33.04 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  32.52 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  31.68 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1838  hypothetical protein  35.79 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1885  hypothetical protein  35.79 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2729  hypothetical protein  29.39 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  28.29 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  34.6 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  32.34 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  30.26 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  35.26 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3726  urea carboxylase-associated protein 2  32.46 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622445 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  29.27 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  29.27 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  28.5 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  33.5 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  28.5 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  30.81 
 
 		 211 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  30.24 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  28.37 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  31.44 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  31.12 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  32.5 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  31.12 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  32 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3667  hypothetical protein  31.66 
 
 		 300 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  28.93 
 
 		 211 aa  99.4  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  33.86 
 
 		 283 aa  99  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  31.98 
 
 		 211 aa  98.6  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  31.63 
 
 		 213 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  26.67 
 
 		 216 aa  98.6  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  28.23 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  32.66 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  32.49 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  32.97 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  30.56 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  32.97 
 
 		 218 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  32.97 
 
 		 218 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  32.07 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  32.26 
 
 		 205 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  29.9 
 
 		 214 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  29.9 
 
 		 214 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  29.9 
 
 		 214 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  31.66 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  31.66 
 
 		 202 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  33.69 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  31.1 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  30.5 
 
 		 212 aa  94.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  28.43 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  32.28 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  29.95 
 
 		 207 aa  93.2  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  28.95 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  27.06 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  25.84 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  26.2 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  30.22 
 
 		 211 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  26.85 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  27.98 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.987033 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  29.47 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>