154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3249 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.987033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1829  hypothetical protein  72.54 
 
 		 198 aa  298  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2465  hypothetical protein  71.81 
 
 		 198 aa  293  9e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2380  hypothetical protein  71.28 
 
 		 198 aa  291  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.697373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2687  hypothetical protein  70.53 
 
 		 198 aa  291  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  69.11 
 
 		 195 aa  288  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2565  hypothetical protein  67.18 
 
 		 206 aa  287  9e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  68.02 
 
 		 198 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01230  hypothetical protein  55.67 
 
 		 197 aa  220  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0918  hypothetical protein  55.56 
 
 		 193 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.670285  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4749  hypothetical protein  41.27 
 
 		 200 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  37.89 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  35.03 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2558  hypothetical protein  36.78 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  34.52 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  33.9 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  33.33 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  31.25 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  32.63 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0329  hypothetical protein  33.14 
 
 		 233 aa  101  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  35.6 
 
 		 211 aa  101  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  30.53 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  30.98 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  30.53 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  31.53 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  33.7 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  31.73 
 
 		 215 aa  98.2  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  30 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  32.32 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  33.52 
 
 		 235 aa  92.8  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  34.24 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  32.79 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  34.25 
 
 		 214 aa  92  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  29.13 
 
 		 211 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  31.38 
 
 		 237 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  31.38 
 
 		 237 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  33.52 
 
 		 216 aa  91.7  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  31.38 
 
 		 237 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  30.1 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  30.73 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  34.09 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2652  hypothetical protein  28.57 
 
 		 222 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1324  hypothetical protein  28.5 
 
 		 224 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  30.37 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2330  hypothetical protein  31.28 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  32.12 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  27.23 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  28.65 
 
 		 216 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  27.17 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  31.87 
 
 		 213 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  31.75 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  28.12 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  30 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  30.11 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  30.41 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  30.53 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  24.34 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  31.22 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  31.94 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  32.73 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.36 
 
 		 761 aa  82  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  31.41 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  31.41 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  31.52 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  31.98 
 
 		 273 aa  81.3  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  31.52 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  30.53 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  27.22 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  31.9 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0573  hypothetical protein  30.22 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.329017  normal  0.178207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.57 
 
 		 772 aa  79  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0110  hypothetical protein  31.95 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  30.57 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  30.32 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0061  hypothetical protein  28.71 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  33.57 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  30.21 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28 
 
 		 781 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.43 
 
 		 789 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  29.59 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  27.96 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  27.96 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3315  hypothetical protein  30.48 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  27.96 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  26.09 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  29.38 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  29.1 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  27.36 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  28.86 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  26.63 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  29.35 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1328  hypothetical protein  26.88 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  30.85 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.85 
 
 		 790 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  29.35 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  28.65 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3109  hypothetical protein  28.22 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  29.48 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  28.36 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>