141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4749 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4749  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  415  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2687  hypothetical protein  42.93 
 
 
198 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  42.86 
 
 
195 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  43.01 
 
 
198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2465  hypothetical protein  42.41 
 
 
198 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2380  hypothetical protein  41.88 
 
 
198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.697373  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1829  hypothetical protein  43.32 
 
 
198 aa  151  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00879192 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01230  hypothetical protein  36.84 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  41.27 
 
 
206 aa  145  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.987033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2565  hypothetical protein  41.71 
 
 
206 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0918  hypothetical protein  36.65 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.670285  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  37.31 
 
 
207 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  30.94 
 
 
204 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  98.6  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  32.77 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  33.86 
 
 
211 aa  94.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0329  hypothetical protein  30.3 
 
 
233 aa  94.7  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  30.39 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  31.44 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  33.16 
 
 
223 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1324  hypothetical protein  31.11 
 
 
224 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621466  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  32.04 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  31.28 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  34.34 
 
 
237 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  34.34 
 
 
237 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  34.34 
 
 
237 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  32.77 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2652  hypothetical protein  31.11 
 
 
222 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  32.45 
 
 
214 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  32.45 
 
 
214 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  32.45 
 
 
214 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  30.05 
 
 
214 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  30.73 
 
 
211 aa  88.2  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  30.21 
 
 
211 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  30.73 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  30.53 
 
 
199 aa  87  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  30 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  32.64 
 
 
219 aa  85.9  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  32.37 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  31.77 
 
 
210 aa  85.9  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  29.69 
 
 
211 aa  84.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  30.86 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  29.9 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  28.18 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  29.9 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  27.84 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  29.23 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  31.15 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  29.8 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  30.94 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  28.8 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  31.02 
 
 
208 aa  82  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  29.14 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  29.55 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  30.56 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  29.19 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  29.83 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  26.6 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  27.37 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2330  hypothetical protein  30.67 
 
 
199 aa  77.8  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2558  hypothetical protein  31.43 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  27.75 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  27.13 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  25.93 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  30.22 
 
 
757 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  27.32 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  29.51 
 
 
217 aa  74.7  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.96 
 
 
752 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.94 
 
 
761 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  28.36 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  31.35 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  30.65 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.11 
 
 
772 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  30.81 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  26.56 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  28.36 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  28.36 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  26.67 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  29.35 
 
 
211 aa  72  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0061  hypothetical protein  30.26 
 
 
285 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  30 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.42 
 
 
789 aa  70.5  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.14 
 
 
781 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  26.15 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.72 
 
 
790 aa  68.2  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.32 
 
 
789 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.32 
 
 
789 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0110  hypothetical protein  31.97 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  24.75 
 
 
244 aa  62.8  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2473  hypothetical protein  27.36 
 
 
289 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.360526  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0802  hypothetical protein  26.32 
 
 
288 aa  59.7  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4087  hypothetical protein  26.06 
 
 
286 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567872  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  27.16 
 
 
274 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1314  hypothetical protein  25.67 
 
 
302 aa  58.5  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  hitchhiker  0.0088422 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  25.77 
 
 
270 aa  57.4  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4449  hypothetical protein  25.13 
 
 
286 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  26.11 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2795  hypothetical protein  25.47 
 
 
286 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  26.26 
 
 
280 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3985  hypothetical protein  25.13 
 
 
286 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.134584 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>