155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4884 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  477  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  78.44 
 
 		 235 aa  360  9e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  71.23 
 
 		 219 aa  333  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  68.14 
 
 		 214 aa  299  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  66.83 
 
 		 215 aa  298  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  66.35 
 
 		 213 aa  295  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  65.88 
 
 		 232 aa  295  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  66.67 
 
 		 216 aa  291  6e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  63.46 
 
 		 214 aa  288  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  63.98 
 
 		 217 aa  288  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  67.17 
 
 		 218 aa  287  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  66.67 
 
 		 218 aa  286  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  68.91 
 
 		 205 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  65.52 
 
 		 211 aa  284  9e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  68.75 
 
 		 205 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  65.5 
 
 		 211 aa  280  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  64.42 
 
 		 211 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  64.08 
 
 		 211 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  63.68 
 
 		 218 aa  279  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  63.21 
 
 		 218 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  63.21 
 
 		 218 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  60.58 
 
 		 212 aa  275  3e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  64.58 
 
 		 212 aa  270  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  58.62 
 
 		 217 aa  255  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  56.25 
 
 		 211 aa  254  8e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  54.55 
 
 		 211 aa  249  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  52.17 
 
 		 216 aa  247  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  50.7 
 
 		 216 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  50.23 
 
 		 216 aa  242  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  53.81 
 
 		 214 aa  241  6e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  56.54 
 
 		 206 aa  240  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  56.54 
 
 		 206 aa  240  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  52.74 
 
 		 216 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  69.18 
 
 		 179 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  53.17 
 
 		 214 aa  238  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  54.59 
 
 		 211 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  58.42 
 
 		 202 aa  237  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  57.07 
 
 		 210 aa  236  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  57.89 
 
 		 208 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  52.82 
 
 		 211 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  53.44 
 
 		 212 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  56.02 
 
 		 211 aa  222  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  52.58 
 
 		 214 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  52.58 
 
 		 214 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  52.58 
 
 		 214 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  51.85 
 
 		 221 aa  215  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  54.3 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  52.74 
 
 		 223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  52.55 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  52.38 
 
 		 199 aa  208  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  34.4 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  37.25 
 
 		 270 aa  135  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  36.84 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  37.81 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  38.73 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  36.17 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  34.8 
 
 		 278 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  37 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  32.68 
 
 		 279 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  36.5 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  36.08 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  36.27 
 
 		 245 aa  118  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  35.29 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  32.5 
 
 		 245 aa  112  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  34.1 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  34.1 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  30.88 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  36.2 
 
 		 280 aa  111  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  34.1 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  34.15 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  34.04 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  32.98 
 
 		 274 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  30.63 
 
 		 280 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  35.86 
 
 		 204 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  34.15 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  33.16 
 
 		 273 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  34.17 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  34.07 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  33.16 
 
 		 273 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  37.97 
 
 		 237 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  37.97 
 
 		 237 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  37.97 
 
 		 237 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  32.99 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  31.9 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2652  hypothetical protein  34 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  32.97 
 
 		 307 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  34.41 
 
 		 235 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  32.12 
 
 		 248 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  32.26 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1324  hypothetical protein  32.5 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1838  hypothetical protein  32.42 
 
 		 307 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1885  hypothetical protein  32.42 
 
 		 307 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  32.07 
 
 		 248 aa  95.9  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  33.87 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  32.07 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  33.89 
 
 		 198 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3667  hypothetical protein  29.03 
 
 		 300 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  33.89 
 
 		 277 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  32.47 
 
 		 283 aa  93.2  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.21 
 
 		 781 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>