157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3978 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  447  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  83.25 
 
 		 213 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  80.48 
 
 		 211 aa  367  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  80 
 
 		 211 aa  367  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  79.05 
 
 		 211 aa  360  7.0000000000000005e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  83 
 
 		 205 aa  358  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  84.38 
 
 		 205 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  70.89 
 
 		 218 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  69.63 
 
 		 218 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  69.95 
 
 		 218 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  69.95 
 
 		 218 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  69.16 
 
 		 218 aa  315  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  67.44 
 
 		 232 aa  311  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  66.2 
 
 		 215 aa  307  9e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  68.12 
 
 		 229 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  65.44 
 
 		 219 aa  300  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  66.05 
 
 		 216 aa  296  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  64.81 
 
 		 217 aa  294  7e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  66.19 
 
 		 211 aa  294  8e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  61.03 
 
 		 214 aa  292  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  67.31 
 
 		 212 aa  290  9e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  64.79 
 
 		 235 aa  285  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  70.31 
 
 		 212 aa  282  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  59.62 
 
 		 211 aa  264  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  57.62 
 
 		 211 aa  262  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  58.13 
 
 		 217 aa  254  7e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  55.72 
 
 		 206 aa  241  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  55.72 
 
 		 206 aa  241  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  54.46 
 
 		 216 aa  240  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  55.56 
 
 		 214 aa  240  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  54.59 
 
 		 214 aa  240  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  56.93 
 
 		 210 aa  238  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  52.8 
 
 		 216 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  53.47 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  55.33 
 
 		 202 aa  235  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  52.34 
 
 		 216 aa  234  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  71.07 
 
 		 179 aa  234  8e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  52.17 
 
 		 208 aa  232  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  53.69 
 
 		 211 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  57.29 
 
 		 211 aa  231  7.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  50.94 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  50.94 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  50.94 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  52 
 
 		 211 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  50 
 
 		 212 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  48.62 
 
 		 223 aa  214  8e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  52.15 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  48.02 
 
 		 221 aa  208  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  49.73 
 
 		 238 aa  201  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  46.34 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  35.98 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  37.26 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  39.8 
 
 		 270 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  37.8 
 
 		 207 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  38.24 
 
 		 270 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  35.44 
 
 		 278 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  37.31 
 
 		 269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  36.7 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  35.94 
 
 		 251 aa  131  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  36.95 
 
 		 270 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  36.27 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  34.31 
 
 		 245 aa  125  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  32.72 
 
 		 257 aa  124  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  35.35 
 
 		 270 aa  124  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  35.29 
 
 		 244 aa  124  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  36.08 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  34.45 
 
 		 275 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  32.51 
 
 		 279 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  35.75 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  33.82 
 
 		 251 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  33.82 
 
 		 251 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  35.15 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  32.55 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  32.67 
 
 		 274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  31.94 
 
 		 245 aa  112  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  111  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  31.66 
 
 		 274 aa  111  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  33.18 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  35.27 
 
 		 280 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  33.64 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  30.26 
 
 		 280 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  36.7 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  36.7 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  36.7 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  32.67 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  33.82 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  35.94 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  35.94 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  34.2 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  33.33 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  31.88 
 
 		 287 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  35.48 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  33.51 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  32.34 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  33.17 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2558  hypothetical protein  34.34 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2652  hypothetical protein  35.2 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  30.99 
 
 		 277 aa  94.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  27.36 
 
 		 268 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>