156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3723 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  100 
 
 		 206 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  94.71 
 
 		 214 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  77.2 
 
 		 216 aa  332  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  74.5 
 
 		 216 aa  327  6e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  74.62 
 
 		 216 aa  327  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  76.68 
 
 		 216 aa  327  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  73.85 
 
 		 211 aa  318  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  73.33 
 
 		 211 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  69.65 
 
 		 214 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  69.9 
 
 		 212 aa  312  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  64.5 
 
 		 211 aa  290  9e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  65.33 
 
 		 210 aa  277  7e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  59.9 
 
 		 215 aa  268  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  57.5 
 
 		 211 aa  256  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  59.9 
 
 		 208 aa  255  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  62.94 
 
 		 211 aa  254  9e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  58.95 
 
 		 202 aa  252  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  56.25 
 
 		 232 aa  248  5e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  58.88 
 
 		 212 aa  246  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  56.57 
 
 		 216 aa  242  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  55.72 
 
 		 214 aa  241  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  56.54 
 
 		 229 aa  240  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  57.95 
 
 		 205 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  56.22 
 
 		 217 aa  238  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  55.17 
 
 		 211 aa  238  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  57.44 
 
 		 205 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  55.56 
 
 		 213 aa  235  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  55.56 
 
 		 211 aa  235  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  56.02 
 
 		 235 aa  235  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  54.73 
 
 		 218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  56.12 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  55.61 
 
 		 211 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  53.23 
 
 		 218 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  52.43 
 
 		 218 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  52.43 
 
 		 218 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  58.47 
 
 		 212 aa  229  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  54.31 
 
 		 221 aa  229  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  52.43 
 
 		 218 aa  228  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  54.69 
 
 		 199 aa  228  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  54 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  49.24 
 
 		 219 aa  220  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  51.53 
 
 		 214 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  51.53 
 
 		 214 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  51.53 
 
 		 214 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  52.31 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  49.03 
 
 		 214 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  48.02 
 
 		 217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  53.89 
 
 		 238 aa  214  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  58.79 
 
 		 179 aa  212  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  35.5 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  35.92 
 
 		 244 aa  144  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  35.86 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  34.85 
 
 		 251 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  36.65 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  37.5 
 
 		 278 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  34.33 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  34.83 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  36.61 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  35.52 
 
 		 277 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  33.17 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  34.5 
 
 		 270 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  32.32 
 
 		 251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  32.32 
 
 		 251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  34.17 
 
 		 270 aa  125  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  32.84 
 
 		 257 aa  124  9e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  34.17 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  35.26 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  34.92 
 
 		 273 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  37.79 
 
 		 280 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  33.33 
 
 		 279 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  34.21 
 
 		 275 aa  121  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  32.28 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  36.46 
 
 		 274 aa  118  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  31.63 
 
 		 245 aa  118  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  31.03 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  38.58 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  35.39 
 
 		 274 aa  115  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  38.07 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  31.16 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  29.35 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  29 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  30.1 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  30.43 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  33.33 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  30.43 
 
 		 245 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  34.05 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  28.44 
 
 		 241 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  33.16 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  36.46 
 
 		 781 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  29.27 
 
 		 239 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  34.43 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  28.5 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  30.1 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1838  hypothetical protein  32.8 
 
 		 307 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1885  hypothetical protein  32.8 
 
 		 307 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  30.2 
 
 		 268 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3667  hypothetical protein  32.75 
 
 		 300 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>