154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1126 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  443  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  75 
 
 		 212 aa  342  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  72.04 
 
 		 211 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  67.18 
 
 		 215 aa  288  4e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  68.81 
 
 		 214 aa  287  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  63.98 
 
 		 213 aa  285  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  64.9 
 
 		 211 aa  286  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  64.95 
 
 		 218 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  65.99 
 
 		 214 aa  285  4e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  66.02 
 
 		 218 aa  285  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  66.02 
 
 		 218 aa  285  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  64.02 
 
 		 218 aa  285  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  67.84 
 
 		 218 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  64.9 
 
 		 211 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  64.73 
 
 		 211 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  66.5 
 
 		 205 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  65.85 
 
 		 217 aa  277  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  59.72 
 
 		 216 aa  276  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  66.33 
 
 		 232 aa  274  7e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  65.99 
 
 		 205 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  64.77 
 
 		 229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  58.77 
 
 		 219 aa  271  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  58.77 
 
 		 235 aa  261  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  56.31 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  53.7 
 
 		 210 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  67.3 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  53.2 
 
 		 216 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  52.4 
 
 		 211 aa  232  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  58.38 
 
 		 214 aa  231  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  56.41 
 
 		 206 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  56.41 
 
 		 206 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  57.3 
 
 		 214 aa  228  7e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  51.92 
 
 		 216 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  51.92 
 
 		 216 aa  224  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  53.85 
 
 		 216 aa  224  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  56.22 
 
 		 211 aa  224  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  52.82 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  53.97 
 
 		 211 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  51.78 
 
 		 211 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  53.06 
 
 		 202 aa  218  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  52.85 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  54.4 
 
 		 211 aa  214  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  49.48 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  49.48 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  49.48 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  53.55 
 
 		 221 aa  205  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  49.74 
 
 		 223 aa  203  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  49.74 
 
 		 199 aa  202  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  46.63 
 
 		 224 aa  194  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  47.15 
 
 		 238 aa  193  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  35.94 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  34.36 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  33.17 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  31.58 
 
 		 251 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  35.57 
 
 		 270 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  31.1 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  31.98 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  31.61 
 
 		 279 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  33.85 
 
 		 270 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  30.96 
 
 		 274 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  32.31 
 
 		 278 aa  108  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  32.46 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  32.99 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  34.2 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  34.2 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  34.2 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  31.09 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  29.65 
 
 		 245 aa  105  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  28.86 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  30.57 
 
 		 277 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  30.26 
 
 		 275 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  30.96 
 
 		 257 aa  101  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  30.73 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  31.77 
 
 		 270 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  32.16 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  30 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  30 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  29.02 
 
 		 280 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  31.25 
 
 		 273 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  29.5 
 
 		 251 aa  98.2  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  30.73 
 
 		 273 aa  98.2  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  35.83 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  29.15 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  29.41 
 
 		 245 aa  96.3  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  29.72 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  27.64 
 
 		 268 aa  92.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  26.6 
 
 		 257 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  31.75 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  29.23 
 
 		 277 aa  89.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  29.08 
 
 		 307 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  28.79 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  28.72 
 
 		 283 aa  88.2  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  29.44 
 
 		 287 aa  88.2  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  29.44 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  28.36 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  28 
 
 		 276 aa  87  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  34.04 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  28.79 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1885  hypothetical protein  28.06 
 
 		 307 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  29.65 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>