120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0047 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  100 
 
 
239 aa  501  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  60.43 
 
 
245 aa  292  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  56.52 
 
 
245 aa  267  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  50.65 
 
 
244 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  46.49 
 
 
243 aa  217  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  51.2 
 
 
244 aa  214  9e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  46.41 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  46.81 
 
 
251 aa  211  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  44.64 
 
 
245 aa  201  7e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  43.83 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  44.78 
 
 
251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  44.78 
 
 
251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  44.78 
 
 
251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  44.49 
 
 
257 aa  195  6e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  43.97 
 
 
257 aa  194  8.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  44.09 
 
 
241 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  43.5 
 
 
241 aa  191  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  43.64 
 
 
241 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  41.99 
 
 
242 aa  188  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  42.36 
 
 
248 aa  184  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  40.53 
 
 
248 aa  175  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  38.36 
 
 
278 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  35.9 
 
 
268 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  35.81 
 
 
244 aa  152  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  34.93 
 
 
243 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  36 
 
 
276 aa  148  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  36 
 
 
269 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  35.53 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  36.16 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  35.19 
 
 
274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  33.77 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  34.05 
 
 
275 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  35.09 
 
 
273 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  33.62 
 
 
280 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  34.21 
 
 
273 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  34.78 
 
 
270 aa  123  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  35.62 
 
 
277 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  36.24 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2729  hypothetical protein  32.59 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  32.91 
 
 
279 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  35.32 
 
 
211 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  32.46 
 
 
280 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  35.27 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  33.5 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  34.3 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  34.98 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  34.03 
 
 
202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  34.33 
 
 
210 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  31.28 
 
 
223 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  30.35 
 
 
211 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  32.34 
 
 
232 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  33.82 
 
 
214 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  29.81 
 
 
214 aa  105  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  33.87 
 
 
211 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  30.35 
 
 
214 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  29.27 
 
 
206 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  29.27 
 
 
206 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  31.47 
 
 
214 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  31.47 
 
 
214 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  31.47 
 
 
214 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  33.52 
 
 
212 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  29.85 
 
 
211 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  33.68 
 
 
277 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  31.58 
 
 
283 aa  99.8  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  29.89 
 
 
216 aa  99  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  33.01 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  33.01 
 
 
218 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  33.01 
 
 
218 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  28.86 
 
 
216 aa  96.3  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  27.8 
 
 
216 aa  95.5  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  35 
 
 
211 aa  94  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  26.38 
 
 
287 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  32.61 
 
 
211 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  32.84 
 
 
217 aa  92.4  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  34.44 
 
 
211 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  32.37 
 
 
199 aa  91.7  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  28.79 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1838  hypothetical protein  30.98 
 
 
307 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1885  hypothetical protein  30.98 
 
 
307 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  26.83 
 
 
216 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3667  hypothetical protein  27.85 
 
 
300 aa  89  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  29.9 
 
 
219 aa  88.6  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  31.98 
 
 
229 aa  88.6  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  31.15 
 
 
221 aa  88.6  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  28.79 
 
 
217 aa  88.6  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  29.35 
 
 
212 aa  88.6  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  28.57 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  29.47 
 
 
214 aa  87  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  29.56 
 
 
211 aa  87.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  29.95 
 
 
205 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  30.43 
 
 
307 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  26.4 
 
 
238 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  28.72 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3726  urea carboxylase-associated protein 2  29.35 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  30.15 
 
 
205 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  32.22 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  27.32 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  26.54 
 
 
179 aa  63.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  27.53 
 
 
206 aa  62.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.987033 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>