157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2395 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  100 
 
 		 211 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  96.68 
 
 		 211 aa  426  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  86.26 
 
 		 211 aa  388  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  81.99 
 
 		 213 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  81.68 
 
 		 214 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  84.82 
 
 		 205 aa  347  9e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  83.77 
 
 		 205 aa  341  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  66.98 
 
 		 218 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  66.98 
 
 		 218 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  66.51 
 
 		 218 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  67.13 
 
 		 218 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  67.13 
 
 		 218 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  67.14 
 
 		 215 aa  300  9e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  64.19 
 
 		 232 aa  290  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  65.52 
 
 		 229 aa  284  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  65.38 
 
 		 212 aa  284  8e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  63.38 
 
 		 216 aa  284  8e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  61.88 
 
 		 214 aa  279  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  62.69 
 
 		 219 aa  277  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  63.08 
 
 		 217 aa  276  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  64.9 
 
 		 212 aa  275  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  63.77 
 
 		 211 aa  275  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  64.18 
 
 		 235 aa  267  8e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  55.92 
 
 		 211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  57.65 
 
 		 217 aa  251  7e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  55.88 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  56.93 
 
 		 211 aa  243  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  56.57 
 
 		 216 aa  242  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  53.62 
 
 		 216 aa  236  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  56.28 
 
 		 214 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  56.12 
 
 		 206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  56.12 
 
 		 206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  52.66 
 
 		 216 aa  231  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  55.45 
 
 		 210 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  54.27 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  68.55 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  54.59 
 
 		 208 aa  223  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  56.77 
 
 		 211 aa  221  8e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  53.65 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  54.82 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  51.78 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  50.25 
 
 		 211 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  51.5 
 
 		 223 aa  207  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  48.5 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  48.5 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  48.5 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  53.76 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  51.08 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  49.72 
 
 		 238 aa  191  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  46.97 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  36.14 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  36.49 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  38.86 
 
 		 207 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  35.68 
 
 		 251 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  35.68 
 
 		 251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  121  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  36.6 
 
 		 270 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  35.57 
 
 		 269 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  32.47 
 
 		 279 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  34.52 
 
 		 270 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  33.5 
 
 		 245 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  32.82 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  32.7 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  32.85 
 
 		 257 aa  112  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  38.3 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  38.3 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  38.3 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  32.18 
 
 		 274 aa  111  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  33.66 
 
 		 270 aa  111  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  34.54 
 
 		 270 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  34.54 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  30.92 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  30.92 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  35.15 
 
 		 204 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  30.77 
 
 		 280 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  33.83 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  30.43 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  31.37 
 
 		 242 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  32.29 
 
 		 273 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  31.48 
 
 		 248 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  33.85 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  33.17 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  32.29 
 
 		 273 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  30.81 
 
 		 243 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  30.1 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  30.99 
 
 		 257 aa  99.8  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  32 
 
 		 248 aa  99.4  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2558  hypothetical protein  36.18 
 
 		 206 aa  99.4  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  33.33 
 
 		 280 aa  98.6  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  30.69 
 
 		 235 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  33.51 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  33.51 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  33.51 
 
 		 204 aa  95.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  32.16 
 
 		 241 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2687  hypothetical protein  32.64 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  34.44 
 
 		 239 aa  92.4  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2380  hypothetical protein  32.12 
 
 		 198 aa  92  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.697373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1829  hypothetical protein  36.72 
 
 		 198 aa  92  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  31.96 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  27.59 
 
 		 268 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>