156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3901 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  94.71 
 
 		 206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  94.71 
 
 		 206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  71.03 
 
 		 216 aa  332  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  73.89 
 
 		 216 aa  330  8e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  71.03 
 
 		 216 aa  329  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  76.77 
 
 		 216 aa  329  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  72.77 
 
 		 211 aa  321  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  72.5 
 
 		 211 aa  316  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  69.86 
 
 		 212 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  70.05 
 
 		 214 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  65.31 
 
 		 211 aa  290  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  66.83 
 
 		 210 aa  289  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  60.89 
 
 		 215 aa  271  7e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  58.37 
 
 		 211 aa  264  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  61.62 
 
 		 208 aa  259  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  56.42 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  56.5 
 
 		 202 aa  253  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  63.78 
 
 		 211 aa  252  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  61.03 
 
 		 212 aa  249  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  57.56 
 
 		 217 aa  249  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  57.44 
 
 		 216 aa  242  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  53.81 
 
 		 229 aa  241  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  56.5 
 
 		 205 aa  240  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  58.12 
 
 		 235 aa  240  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  55.34 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  55.56 
 
 		 214 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  56.72 
 
 		 205 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  53.88 
 
 		 218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  56.35 
 
 		 223 aa  238  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  59.02 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  56.12 
 
 		 211 aa  235  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  55.78 
 
 		 213 aa  234  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  56.28 
 
 		 211 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  55.22 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  53.43 
 
 		 218 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  53.43 
 
 		 218 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  58.38 
 
 		 212 aa  231  8.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  53.43 
 
 		 218 aa  230  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  51.82 
 
 		 221 aa  229  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  54.69 
 
 		 199 aa  228  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  52.28 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  52.28 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  52.28 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  53.57 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  48.26 
 
 		 219 aa  220  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  50.98 
 
 		 214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  53.23 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  50.26 
 
 		 217 aa  218  7e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  58.08 
 
 		 179 aa  212  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  36.22 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  37.14 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  35.82 
 
 		 251 aa  141  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  35.96 
 
 		 207 aa  141  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  35.82 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  34.31 
 
 		 244 aa  131  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  32.84 
 
 		 251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  32.84 
 
 		 251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  33.66 
 
 		 251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  33.83 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  35.98 
 
 		 270 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  36.08 
 
 		 278 aa  128  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  33.83 
 
 		 270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  33.86 
 
 		 277 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  33.85 
 
 		 269 aa  125  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  35.42 
 
 		 273 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  32.47 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  33.85 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  35.32 
 
 		 274 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  35.08 
 
 		 273 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  31.37 
 
 		 245 aa  121  9e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  32.52 
 
 		 275 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  37.21 
 
 		 280 aa  119  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  33 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  32.14 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  33.85 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  30.1 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  30.69 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  37.82 
 
 		 204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  37.82 
 
 		 204 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  30.33 
 
 		 248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  28.02 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  28.64 
 
 		 241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  32.26 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  29.7 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  32.64 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  30.29 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  28.29 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  34.59 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  29.81 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  26.82 
 
 		 241 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  34.97 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  35.98 
 
 		 781 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  30.77 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3667  hypothetical protein  32.16 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  32.75 
 
 		 283 aa  101  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  32.63 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  26.36 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.95 
 
 		 772 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>