149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1202 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  480  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  480  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  480  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0329  hypothetical protein  49.21 
 
 
233 aa  175  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  48.65 
 
 
238 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  44.26 
 
 
204 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  40.31 
 
 
204 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  40.31 
 
 
204 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1324  hypothetical protein  38.29 
 
 
224 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621466  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2652  hypothetical protein  42.64 
 
 
222 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2558  hypothetical protein  42.93 
 
 
206 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2330  hypothetical protein  40.41 
 
 
199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  36.79 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  37.37 
 
 
204 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  36.18 
 
 
211 aa  125  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0110  hypothetical protein  44.59 
 
 
177 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  38.89 
 
 
207 aa  119  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  35.9 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  35.71 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  38.3 
 
 
211 aa  112  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  34.76 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  36.55 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  36.13 
 
 
213 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  37.97 
 
 
211 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  35.1 
 
 
214 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  37.5 
 
 
208 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  36.27 
 
 
215 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  36.36 
 
 
205 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  37.97 
 
 
205 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  34.57 
 
 
211 aa  105  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  33.17 
 
 
211 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  36.9 
 
 
214 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  35.16 
 
 
212 aa  105  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  37.97 
 
 
229 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.68 
 
 
772 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  36.32 
 
 
211 aa  102  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  37.21 
 
 
195 aa  101  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2656  hypothetical protein  33.51 
 
 
211 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1328  hypothetical protein  31.96 
 
 
211 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  34.8 
 
 
218 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  34.8 
 
 
218 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  34.2 
 
 
217 aa  99.8  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  33.85 
 
 
219 aa  99.4  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  36.46 
 
 
217 aa  98.2  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  33.82 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0918  hypothetical protein  29.67 
 
 
193 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.670285  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  34.2 
 
 
211 aa  96.3  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  32.32 
 
 
212 aa  96.3  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  34.85 
 
 
757 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  31.61 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  31.61 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.5 
 
 
752 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  34.01 
 
 
216 aa  92.4  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.33 
 
 
761 aa  92  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  34.5 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  31.38 
 
 
206 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.987033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  31.58 
 
 
216 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2565  hypothetical protein  36.63 
 
 
206 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  32.99 
 
 
235 aa  89.4  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4749  hypothetical protein  34.34 
 
 
200 aa  89.4  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.95 
 
 
790 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  31.16 
 
 
211 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.14 
 
 
789 aa  89  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  33.15 
 
 
198 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  32.79 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01230  hypothetical protein  30.12 
 
 
197 aa  87  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  32.24 
 
 
212 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.13 
 
 
781 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2687  hypothetical protein  34.88 
 
 
198 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  32.24 
 
 
221 aa  86.3  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  30.48 
 
 
216 aa  85.9  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  33.15 
 
 
199 aa  85.9  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1829  hypothetical protein  32.93 
 
 
198 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00879192 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  35.9 
 
 
179 aa  85.1  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  30.26 
 
 
214 aa  84  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2380  hypothetical protein  34.3 
 
 
198 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.697373  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2465  hypothetical protein  34.3 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  32.42 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  32.24 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  30.11 
 
 
211 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  28.93 
 
 
216 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  32.24 
 
 
273 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  30.81 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.93 
 
 
789 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  29.81 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  32.42 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.57 
 
 
789 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  29.7 
 
 
244 aa  79  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  28.49 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  31.32 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  31.32 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  31.32 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4449  hypothetical protein  30.59 
 
 
286 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0573  hypothetical protein  30.88 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.329017  normal  0.178207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  30.43 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3985  hypothetical protein  30.88 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1314  hypothetical protein  30.09 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  hitchhiker  0.0088422 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4087  hypothetical protein  30.18 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567872  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  30.61 
 
 
269 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>