129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4087 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4087  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  597  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567872  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3985  hypothetical protein  91.96 
 
 
286 aa  557  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4449  hypothetical protein  92.31 
 
 
286 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1314  hypothetical protein  79.29 
 
 
302 aa  487  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  hitchhiker  0.0088422 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3315  hypothetical protein  75.71 
 
 
278 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4036  hypothetical protein  72.5 
 
 
283 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278861  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2796  hypothetical protein  70.14 
 
 
283 aa  427  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0112112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2524  hypothetical protein  70.61 
 
 
310 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578809  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2182  hypothetical protein  60.07 
 
 
299 aa  340  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230731  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45364  predicted protein  58.84 
 
 
300 aa  324  8.000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0471946 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06335  conserved hypothetical protein  53.22 
 
 
312 aa  309  2.9999999999999997e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246727  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3109  hypothetical protein  53.82 
 
 
285 aa  256  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0061  hypothetical protein  55.42 
 
 
285 aa  248  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0573  hypothetical protein  50.4 
 
 
277 aa  234  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.329017  normal  0.178207 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2795  hypothetical protein  50.2 
 
 
286 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2473  hypothetical protein  52.14 
 
 
289 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.360526  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40950  predicted protein  45.45 
 
 
312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0802  hypothetical protein  47.37 
 
 
288 aa  219  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  31.02 
 
 
207 aa  92.8  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  33.16 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  32.26 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2797  hypothetical protein  62.5 
 
 
56 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000398858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  35.2 
 
 
205 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  31.02 
 
 
210 aa  79  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  32.8 
 
 
205 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  28.65 
 
 
211 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  30.26 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  31.41 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  30.81 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  30.81 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  33.71 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  29.89 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  28.44 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  30.53 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  27.96 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  28.96 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  32.43 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  30.18 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  30.18 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  30.18 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  33.5 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  29.26 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.987033 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  31.12 
 
 
215 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  30.3 
 
 
211 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  28.42 
 
 
198 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  28.93 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01230  hypothetical protein  26.26 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2687  hypothetical protein  29.19 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  26.74 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  28.26 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  28.26 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  29.69 
 
 
232 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1829  hypothetical protein  30 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00879192 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  31.5 
 
 
214 aa  67  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2465  hypothetical protein  28.65 
 
 
198 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0918  hypothetical protein  27.14 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.670285  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2380  hypothetical protein  28.65 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.697373  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2565  hypothetical protein  28.96 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  26.29 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  29.27 
 
 
204 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  24.04 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  25 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  26.7 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  28.78 
 
 
204 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  25.69 
 
 
278 aa  62.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2652  hypothetical protein  26.47 
 
 
222 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  30 
 
 
219 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  25.66 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  26.47 
 
 
235 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  27.31 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25 
 
 
789 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  22.5 
 
 
216 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  30.58 
 
 
211 aa  60.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.87 
 
 
789 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  24.04 
 
 
279 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  31.82 
 
 
229 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1324  hypothetical protein  24.41 
 
 
224 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621466  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  28.99 
 
 
218 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  28.99 
 
 
218 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4749  hypothetical protein  26.06 
 
 
200 aa  59.3  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  28.5 
 
 
218 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  23 
 
 
216 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  25 
 
 
243 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  28.02 
 
 
218 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  28.85 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  28.71 
 
 
217 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  27.75 
 
 
238 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.98 
 
 
789 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  28.44 
 
 
211 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  28.99 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  28.42 
 
 
208 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  24.86 
 
 
273 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  28.04 
 
 
202 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  24.44 
 
 
270 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  26.52 
 
 
268 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.61 
 
 
790 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  24.89 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  25.41 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  24.15 
 
 
269 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0329  hypothetical protein  24.86 
 
 
233 aa  53.9  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>