12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2797 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2797  hypothetical protein  100 
 
 		 56 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000398858  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2524  hypothetical protein  92.86 
 
 		 310 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578809  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2796  hypothetical protein  92.86 
 
 		 283 aa  114  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0112112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4036  hypothetical protein  82.14 
 
 		 283 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278861  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4449  hypothetical protein  69.09 
 
 		 286 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3985  hypothetical protein  67.86 
 
 		 286 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4087  hypothetical protein  62.5 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1314  hypothetical protein  57.14 
 
 		 302 aa  77  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  hitchhiker  0.0088422 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3315  hypothetical protein  59.26 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2182  hypothetical protein  46.15 
 
 		 299 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230731  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06335  conserved hypothetical protein  43.75 
 
 		 312 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45364  predicted protein  38.46 
 
 		 300 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0471946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>