136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01230 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01230  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  410  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0918  hypothetical protein  76.56 
 
 		 193 aa  311  3.9999999999999997e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.670285  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  58.42 
 
 		 195 aa  228  6e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1829  hypothetical protein  57.37 
 
 		 198 aa  224  9e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  55.67 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.987033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2380  hypothetical protein  55.73 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.697373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2465  hypothetical protein  55.73 
 
 		 198 aa  217  7e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2687  hypothetical protein  55.21 
 
 		 198 aa  215  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  56.08 
 
 		 198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2565  hypothetical protein  54.26 
 
 		 206 aa  211  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4749  hypothetical protein  36.84 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  33.16 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  32 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0329  hypothetical protein  29.55 
 
 		 233 aa  87.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  29.48 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  30.12 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  30.12 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  30.12 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  28.96 
 
 		 211 aa  85.9  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  31.25 
 
 		 238 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  28.9 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2330  hypothetical protein  29.02 
 
 		 199 aa  85.5  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  28.11 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  28.93 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  28.57 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  29.67 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  28.18 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  27.08 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  28.43 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  27.95 
 
 		 273 aa  78.2  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  26.34 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  27.17 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  28.65 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  27.33 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1324  hypothetical protein  26.57 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2652  hypothetical protein  25.76 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  29.61 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  27.57 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  26.78 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  26.8 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  27.03 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  26.77 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  27.96 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  24.84 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  25.26 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  25.13 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2558  hypothetical protein  27.43 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  28.06 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  24.61 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  25.76 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.32 
 
 		 772 aa  72  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  24.08 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  27.84 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  27.55 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4087  hypothetical protein  26.26 
 
 		 286 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  25.93 
 
 		 270 aa  71.2  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1328  hypothetical protein  25.58 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.11 
 
 		 761 aa  70.9  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  25.28 
 
 		 757 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  26.42 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  28.57 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  25.4 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  27.22 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  27.22 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  25 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  24.51 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  23.33 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.28 
 
 		 790 aa  68.6  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  25.29 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2729  hypothetical protein  24.1 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  22.87 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  22.78 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  22.78 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  28.02 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2656  hypothetical protein  24.59 
 
 		 211 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  23.35 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.73 
 
 		 752 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4449  hypothetical protein  25.25 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  24.87 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  25.93 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3985  hypothetical protein  25.25 
 
 		 286 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  25.93 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  26.94 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.52 
 
 		 789 aa  66.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  24.34 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  27.37 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  22.4 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.95 
 
 		 781 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  25.4 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  26.42 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  25.82 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  23.81 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  23.21 
 
 		 278 aa  64.7  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3315  hypothetical protein  24.18 
 
 		 278 aa  64.7  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06335  conserved hypothetical protein  24.06 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246727  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2796  hypothetical protein  24.61 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0112112  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  23.33 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  25.28 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0110  hypothetical protein  28.4 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1314  hypothetical protein  24.24 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  hitchhiker  0.0088422 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>