103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1328 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1328  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2656  hypothetical protein  88.15 
 
 		 211 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  31.96 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  31.96 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  31.96 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0329  hypothetical protein  30.68 
 
 		 233 aa  92  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  30.68 
 
 		 238 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  32.37 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  31.76 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  31.76 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  28.57 
 
 		 204 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  32.57 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2380  hypothetical protein  31.58 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.697373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1324  hypothetical protein  26.5 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2652  hypothetical protein  26.63 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2465  hypothetical protein  30.53 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  31.4 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2558  hypothetical protein  32.35 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  26.88 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.987033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2565  hypothetical protein  30.27 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2687  hypothetical protein  30 
 
 		 198 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2330  hypothetical protein  30.86 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0110  hypothetical protein  32.28 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.46 
 
 		 772 aa  72.4  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.98 
 
 		 752 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01230  hypothetical protein  25.58 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  28.42 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  30.06 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  30.06 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  30.06 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1829  hypothetical protein  29.88 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879192 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0918  hypothetical protein  23.26 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.670285  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.37 
 
 		 761 aa  65.9  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  26.9 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  25.68 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  26.47 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  29.94 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  27.84 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  25.48 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  26.04 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  25.44 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  27.98 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.28 
 
 		 789 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  25.31 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.27 
 
 		 789 aa  58.5  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.67 
 
 		 789 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  26.38 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  27.65 
 
 		 757 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  26.84 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  28.09 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  24.29 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  26.2 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  25.41 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  26.19 
 
 		 277 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  25 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  28.33 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  25.29 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  29.02 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.81 
 
 		 781 aa  52  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  27.43 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  25.29 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  23.04 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  26.26 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  27.53 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  27.36 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  26.2 
 
 		 257 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  25 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  24.06 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  26.29 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4749  hypothetical protein  25.42 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  25.25 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  23.83 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  24.48 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  25.61 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  24.71 
 
 		 269 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  26.09 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  24.71 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  24.43 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.54 
 
 		 790 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  24.71 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  25.44 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  24.12 
 
 		 270 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  24.74 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  22.73 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  26.11 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  26.4 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  26.54 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  25 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  27.16 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  23.12 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  27.16 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  27.16 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  24.16 
 
 		 245 aa  44.3  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  23.08 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  25.31 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  26.79 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  23.46 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  25.12 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  23.94 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  24.61 
 
 		 214 aa  42  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>