154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1918 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  374  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  72.15 
 
 
215 aa  259  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  74.05 
 
 
216 aa  254  4e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  71.15 
 
 
232 aa  242  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  70.99 
 
 
218 aa  239  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  69.18 
 
 
229 aa  239  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  70.44 
 
 
235 aa  239  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  70.37 
 
 
218 aa  236  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  69.75 
 
 
218 aa  236  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  68.55 
 
 
219 aa  236  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  69.14 
 
 
218 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  69.14 
 
 
218 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  67.3 
 
 
212 aa  234  6e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  67.92 
 
 
212 aa  234  6e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  71.07 
 
 
214 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  70 
 
 
211 aa  228  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  73.65 
 
 
213 aa  226  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  66.03 
 
 
217 aa  226  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  65.5 
 
 
211 aa  224  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  71.43 
 
 
211 aa  223  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  75 
 
 
205 aa  223  9e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  68.55 
 
 
211 aa  223  9e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  73.65 
 
 
205 aa  221  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  63.58 
 
 
214 aa  220  7e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  62.18 
 
 
217 aa  213  9e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  58.08 
 
 
214 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  58.79 
 
 
206 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  58.79 
 
 
206 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  60.13 
 
 
211 aa  208  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  58.86 
 
 
211 aa  207  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  60.54 
 
 
216 aa  206  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  57.14 
 
 
216 aa  206  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  57.89 
 
 
216 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  59.73 
 
 
212 aa  201  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  54.3 
 
 
216 aa  201  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  58.5 
 
 
211 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  58.55 
 
 
214 aa  197  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  57.89 
 
 
210 aa  197  7.999999999999999e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  52.1 
 
 
211 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  57.33 
 
 
208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  56.38 
 
 
202 aa  181  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  55.33 
 
 
223 aa  180  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  57.62 
 
 
211 aa  176  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  49.11 
 
 
214 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  49.11 
 
 
214 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  49.11 
 
 
214 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  50.31 
 
 
221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  50 
 
 
199 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  50 
 
 
238 aa  165  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  52.11 
 
 
224 aa  164  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  36.71 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  36.6 
 
 
244 aa  111  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  38.96 
 
 
269 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  40.14 
 
 
207 aa  108  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  35.58 
 
 
251 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  39.61 
 
 
270 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  36.36 
 
 
251 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  38.36 
 
 
270 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  33.54 
 
 
274 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  35.88 
 
 
270 aa  99.8  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  36.6 
 
 
275 aa  98.2  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  34.16 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  33.33 
 
 
280 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  33.97 
 
 
279 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  38.3 
 
 
273 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  38.3 
 
 
273 aa  94.4  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  32.48 
 
 
278 aa  94.4  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  31.65 
 
 
274 aa  94  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  35.76 
 
 
198 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  30.97 
 
 
280 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  26.88 
 
 
245 aa  89  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  32.9 
 
 
251 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  32.9 
 
 
251 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  34.25 
 
 
270 aa  88.2  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  32.9 
 
 
251 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  32.47 
 
 
257 aa  87.8  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  31.48 
 
 
244 aa  87.8  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  32.24 
 
 
257 aa  87  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  29.45 
 
 
245 aa  85.5  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  28.83 
 
 
268 aa  85.5  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  35.9 
 
 
237 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  35.9 
 
 
237 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  35.9 
 
 
237 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  33.57 
 
 
277 aa  85.1  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  31.1 
 
 
276 aa  84.3  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  32.24 
 
 
243 aa  84  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  35.98 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3667  hypothetical protein  27.63 
 
 
300 aa  81.6  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  35.98 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3726  urea carboxylase-associated protein 2  28.29 
 
 
281 aa  79  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622445 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  38.85 
 
 
204 aa  77.8  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  33.57 
 
 
206 aa  77.4  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.987033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  27.63 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1829  hypothetical protein  32.45 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00879192 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  35.77 
 
 
238 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  29.14 
 
 
241 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  28.19 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  31.43 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  26.92 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2565  hypothetical protein  32.41 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>