142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3889 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  79.38 
 
 		 199 aa  330  9e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  76.73 
 
 		 223 aa  319  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  70.91 
 
 		 214 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  70.91 
 
 		 214 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  70.91 
 
 		 214 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  70.26 
 
 		 202 aa  286  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  64.5 
 
 		 208 aa  271  7e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  60.98 
 
 		 238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  62.75 
 
 		 224 aa  267  8e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  62.25 
 
 		 211 aa  260  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  57.29 
 
 		 211 aa  246  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  55.5 
 
 		 211 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  54.15 
 
 		 214 aa  239  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  53.43 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  54.9 
 
 		 211 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  53.27 
 
 		 216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  56.44 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  51.82 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  54.31 
 
 		 206 aa  229  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  54.31 
 
 		 206 aa  229  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  53.3 
 
 		 216 aa  228  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  52.53 
 
 		 215 aa  227  9e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  52.04 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  53.43 
 
 		 214 aa  226  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  53.33 
 
 		 216 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  52.82 
 
 		 216 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  52.48 
 
 		 211 aa  218  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  51.64 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  52.11 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  51.85 
 
 		 229 aa  215  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  50.5 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  50.23 
 
 		 218 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  49.77 
 
 		 218 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  49.77 
 
 		 218 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  51.49 
 
 		 211 aa  211  7e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  47.95 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  55.25 
 
 		 217 aa  208  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  51.58 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  48 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  49.76 
 
 		 232 aa  204  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  53.55 
 
 		 212 aa  204  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  49.05 
 
 		 217 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  53.76 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  53.76 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  49 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  50 
 
 		 205 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  50 
 
 		 212 aa  199  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  47.85 
 
 		 216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  50.31 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  34.62 
 
 		 243 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  36.09 
 
 		 207 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  36.27 
 
 		 251 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  35.42 
 
 		 251 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  33.68 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  34.38 
 
 		 244 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  35.94 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  37.64 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  30.19 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  36.07 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  36.84 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  29.9 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  28.44 
 
 		 270 aa  96.3  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  30.73 
 
 		 251 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  30.73 
 
 		 251 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  30.73 
 
 		 251 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  28 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  29.56 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  29.19 
 
 		 270 aa  92  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  28.5 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  32.4 
 
 		 277 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  30.35 
 
 		 274 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4749  hypothetical protein  32.77 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  31.15 
 
 		 239 aa  88.6  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  32.24 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  32.24 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  32.24 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  30.48 
 
 		 198 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  27.6 
 
 		 257 aa  85.1  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  29.26 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  27.09 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  26.87 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1829  hypothetical protein  31.32 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  26.55 
 
 		 268 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2565  hypothetical protein  30.85 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  27.88 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  31.52 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  30.05 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  31.11 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  27.66 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  27.62 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  30 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  26.79 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  29.95 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  30.11 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  28.86 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  26.42 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  29.44 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.79 
 
 		 781 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2687  hypothetical protein  29.73 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.525319 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>