145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1890 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  568  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  48.67 
 
 		 269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  48.48 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  51.15 
 
 		 270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  51.29 
 
 		 279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  48.68 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  50.39 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  52.23 
 
 		 277 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  48.48 
 
 		 270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  46.49 
 
 		 275 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  50.9 
 
 		 273 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  50 
 
 		 273 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  44.03 
 
 		 243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2729  hypothetical protein  48.05 
 
 		 260 aa  201  8e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  43.61 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  43.29 
 
 		 244 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  39.91 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  40.83 
 
 		 274 aa  172  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  42.55 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  39.06 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  40.43 
 
 		 235 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  34.65 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  40.22 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  38.33 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  34.2 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  37.5 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  37.5 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  38.03 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  39.71 
 
 		 215 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  39.3 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  38.49 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  38.36 
 
 		 239 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  38.86 
 
 		 241 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  37.71 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  37.66 
 
 		 268 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  35.17 
 
 		 243 aa  151  8.999999999999999e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  37.99 
 
 		 241 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  39.83 
 
 		 242 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  38.7 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  38.05 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  35.98 
 
 		 245 aa  145  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  38.54 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  35.32 
 
 		 211 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  35.68 
 
 		 211 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  35.42 
 
 		 216 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  34.67 
 
 		 211 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  35.68 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  41.43 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  38.14 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  33.8 
 
 		 232 aa  135  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  35.64 
 
 		 213 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  35.71 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  34.98 
 
 		 214 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  35.29 
 
 		 216 aa  132  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  35.08 
 
 		 216 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  37.5 
 
 		 206 aa  132  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  37.5 
 
 		 206 aa  132  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  34.62 
 
 		 214 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  34.62 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  36.18 
 
 		 218 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  36.08 
 
 		 214 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  35.14 
 
 		 216 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  35.68 
 
 		 218 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  37.76 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  34.8 
 
 		 229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  35.47 
 
 		 211 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3726  urea carboxylase-associated protein 2  37.5 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622445 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  32.86 
 
 		 214 aa  123  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  33.98 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  33.33 
 
 		 211 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  32.9 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  32.66 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3667  hypothetical protein  36.96 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  38.81 
 
 		 283 aa  118  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  33.67 
 
 		 217 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  33.84 
 
 		 208 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  32.83 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1838  hypothetical protein  37.84 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1885  hypothetical protein  37.84 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  33.81 
 
 		 218 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  33.51 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  34.6 
 
 		 218 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  34.6 
 
 		 218 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  33.51 
 
 		 205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  34.33 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  34.33 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  37.3 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  34.33 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  33.67 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  33.33 
 
 		 211 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  32.2 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  35.93 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  36.11 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  37.43 
 
 		 202 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  32.07 
 
 		 212 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  30.19 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  33.51 
 
 		 199 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  31.82 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  32.48 
 
 		 179 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  30.98 
 
 		 207 aa  92  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>