274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6330 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  100 
 
 
312 aa  636    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  52.98 
 
 
305 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  52.98 
 
 
305 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  56.29 
 
 
314 aa  338  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  53.82 
 
 
304 aa  336  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  55.63 
 
 
314 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  55.26 
 
 
313 aa  331  8e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  53.49 
 
 
313 aa  330  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  50.5 
 
 
303 aa  328  5.0000000000000004e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  53.16 
 
 
305 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  51.16 
 
 
303 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  52.16 
 
 
305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  54.3 
 
 
314 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  52.17 
 
 
303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  52.16 
 
 
305 aa  326  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  51.5 
 
 
303 aa  322  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  50.17 
 
 
303 aa  319  3e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  49.17 
 
 
303 aa  318  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  48.67 
 
 
303 aa  305  7e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  47.84 
 
 
307 aa  301  8.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  47.85 
 
 
307 aa  300  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  48.18 
 
 
308 aa  297  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  46.53 
 
 
308 aa  291  1e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  47.02 
 
 
306 aa  291  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  49.67 
 
 
305 aa  289  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  50.82 
 
 
318 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  48.05 
 
 
308 aa  285  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  48.17 
 
 
306 aa  283  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  44.52 
 
 
306 aa  277  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  48.17 
 
 
304 aa  271  8.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  42.95 
 
 
297 aa  253  3e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  44.7 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  41.72 
 
 
302 aa  229  5e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  33.55 
 
 
320 aa  189  4e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  28.2 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  26.76 
 
 
313 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1282  putative ribokinase  27.94 
 
 
345 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.331017 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  31.25 
 
 
313 aa  59.3  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2482  ribokinase-like domain-containing protein  42.39 
 
 
349 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  34.01 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  27.97 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  38.05 
 
 
283 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  23.84 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  27.22 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  27.22 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  27.22 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  26.82 
 
 
310 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  27.22 
 
 
315 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  27.22 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  28.21 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  27.22 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  28.16 
 
 
315 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  27.22 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  27.46 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  26.24 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  28.21 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  33.66 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  27.83 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  27.56 
 
 
333 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  26.24 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  32.03 
 
 
330 aa  53.9  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  32.03 
 
 
330 aa  53.9  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  29.15 
 
 
343 aa  53.5  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0331  carbohydrate kinase  30.32 
 
 
318 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0561614  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4553  ribokinase-like domain-containing protein  37.84 
 
 
311 aa  53.5  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  29.65 
 
 
304 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0629  carbohydrate kinase  30.32 
 
 
318 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2463  carbohydrate kinase  30.32 
 
 
318 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  31.65 
 
 
312 aa  53.5  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0077  carbohydrate kinase  30.32 
 
 
318 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0693  carbohydrate kinase  30.38 
 
 
271 aa  53.1  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  24.58 
 
 
302 aa  52.8  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  36.08 
 
 
320 aa  52.8  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  26.42 
 
 
317 aa  52.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1072  PfkB  39.53 
 
 
295 aa  52.8  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.757456  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1032  carbohydrate kinase  30.32 
 
 
318 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  34 
 
 
314 aa  52.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  47.37 
 
 
298 aa  52.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0869  PfkB family kinase  30.32 
 
 
318 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  35.11 
 
 
319 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  27.49 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  45.05 
 
 
293 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0873  PfkB family kinase  30.32 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  24.51 
 
 
285 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00450  expressed protein  25.15 
 
 
436 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.98204  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  26.67 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  31.31 
 
 
313 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  31.31 
 
 
313 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0922  ribokinase-like domain-containing protein  26.75 
 
 
289 aa  50.8  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  31.31 
 
 
313 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  27 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  28.26 
 
 
309 aa  50.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  26.63 
 
 
310 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  32.48 
 
 
300 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3683  adenosine kinase  32.63 
 
 
312 aa  50.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235022  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  24.9 
 
 
300 aa  49.7  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0117  adenosine kinase  32.63 
 
 
312 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0600  adenosine kinase  32.63 
 
 
312 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  32.79 
 
 
306 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  35.92 
 
 
319 aa  50.1  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>