More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1131 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  629  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  80.13 
 
 		 307 aa  508  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  64.17 
 
 		 308 aa  436  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  64.8 
 
 		 306 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  64.69 
 
 		 306 aa  414  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  63.04 
 
 		 305 aa  408  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  60.86 
 
 		 306 aa  391  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  59.34 
 
 		 308 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  54.82 
 
 		 303 aa  353  2e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  54.82 
 
 		 303 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  54.49 
 
 		 303 aa  344  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  53.51 
 
 		 303 aa  343  2e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  52.17 
 
 		 303 aa  338  9e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  52.65 
 
 		 303 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  53.49 
 
 		 303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  51.16 
 
 		 318 aa  329  3e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  51.16 
 
 		 304 aa  319  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  51.33 
 
 		 305 aa  318  9e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  51.5 
 
 		 313 aa  317  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  50.33 
 
 		 305 aa  317  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  48.84 
 
 		 313 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  50.83 
 
 		 305 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  51 
 
 		 305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  50.67 
 
 		 305 aa  311  9e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  48.17 
 
 		 314 aa  308  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  48.17 
 
 		 314 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  48.17 
 
 		 314 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  47.85 
 
 		 312 aa  300  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  47.25 
 
 		 308 aa  291  7e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  47.32 
 
 		 304 aa  286  4e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  43.89 
 
 		 310 aa  265  5e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  41.67 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  36.96 
 
 		 302 aa  208  9e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  32.38 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  25.78 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  26.2 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  23.6 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  25.91 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  29.45 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  27.27 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  36.62 
 
 		 403 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  26.07 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  33.57 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  25.5 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  26.38 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  23.05 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  38.3 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  35.51 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  35.51 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  26.83 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  26 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  25.28 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  25.28 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  24.91 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  26.72 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  24.52 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  26.02 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1285  D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  28.52 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.541266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  36.8 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3037  PfkB domain protein  24.91 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272424 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  25.67 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  25.28 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  25.35 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  26.86 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  25.55 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  25.67 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  29.93 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  29.93 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  29.93 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  33.87 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  24.53 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  30.6 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  24.91 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  24.91 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  24.91 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  25.64 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  25.75 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  24.76 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  23.44 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  29.89 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  24.45 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  26.32 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  32.23 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2351  ribokinase-like domain-containing protein  23.27 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153207  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00998  PfkB family carbohydrate kinase (Mak32), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12750)  24.5 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  24.51 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  23.26 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  25.24 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  24.41 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  33.33 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  25.11 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  24.46 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  23.51 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  28.12 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0487  ribokinase-like domain-containing protein  22.71 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  25.41 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  30.08 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  24.73 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  29.66 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>