More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1084 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 303 aa  625  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  84.77 
 
 		 303 aa  542  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  82.72 
 
 		 303 aa  534  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  82.51 
 
 		 303 aa  533  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  79.87 
 
 		 303 aa  519  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  80.13 
 
 		 303 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  77.15 
 
 		 303 aa  499  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  56.29 
 
 		 305 aa  364  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  56.29 
 
 		 313 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  56.44 
 
 		 306 aa  361  7.0000000000000005e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  55.67 
 
 		 307 aa  359  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  55.3 
 
 		 304 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  55.85 
 
 		 318 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  52.15 
 
 		 305 aa  351  8e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  54.3 
 
 		 305 aa  350  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  53.14 
 
 		 305 aa  349  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  53.97 
 
 		 305 aa  348  6e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  54.79 
 
 		 305 aa  347  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  54.49 
 
 		 307 aa  344  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  52 
 
 		 308 aa  332  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  51 
 
 		 306 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  50.83 
 
 		 314 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  51.16 
 
 		 314 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  51.16 
 
 		 313 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  50.5 
 
 		 314 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  51.5 
 
 		 312 aa  322  5e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  52.33 
 
 		 306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  50.17 
 
 		 308 aa  318  9e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  50.65 
 
 		 308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  45.36 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  43.61 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  42.91 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  41.55 
 
 		 302 aa  231  9e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  30.65 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  27.36 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  27.64 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  27.39 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  28.3 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  26.98 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  26.95 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  29.17 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  28.44 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  27.94 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  39.17 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  34.13 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  28.94 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  33.59 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  33.33 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0800  ribokinase-like domain-containing protein  25.38 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  28.23 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  28.76 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  27.18 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  22.88 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  34.86 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  25.33 
 
 		 343 aa  62.4  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  26.36 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  24.52 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  26.72 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  28.76 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  28.76 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  25.62 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  22.22 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  28.76 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  26.35 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  28.76 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  28.76 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  36.45 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  31.39 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  30.07 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  31.39 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  26.12 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  25.55 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  26.12 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  23.53 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  25.46 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  26.12 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  26.12 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  26.12 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  31.45 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  26.25 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  25.77 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  31.15 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  26.25 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  25.18 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  26.25 
 
 		 404 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  26.25 
 
 		 404 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  34.38 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  26.25 
 
 		 404 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  24.68 
 
 		 325 aa  58.9  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  25.71 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  21.86 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.73 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  24.9 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  27.44 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  25.62 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  31.97 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  25.18 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  23.53 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  25.62 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>