More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1514 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  100 
 
 		 318 aa  646    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  54.13 
 
 		 303 aa  358  5e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  55.52 
 
 		 303 aa  358  6e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  53.47 
 
 		 303 aa  358  8e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  53.85 
 
 		 303 aa  357  9.999999999999999e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  55.85 
 
 		 303 aa  355  5.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  54.18 
 
 		 303 aa  354  1e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  51.32 
 
 		 306 aa  344  1e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  50 
 
 		 307 aa  342  4e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  52.51 
 
 		 303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  56.17 
 
 		 313 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  53.62 
 
 		 313 aa  330  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  53.29 
 
 		 305 aa  329  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  53.16 
 
 		 305 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  51.16 
 
 		 307 aa  329  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  50.33 
 
 		 306 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  52.63 
 
 		 305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  51.83 
 
 		 304 aa  326  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  53.48 
 
 		 314 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  53.16 
 
 		 314 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  51.97 
 
 		 305 aa  322  7e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  50.66 
 
 		 305 aa  316  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  50 
 
 		 305 aa  316  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  52.53 
 
 		 314 aa  315  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  47.84 
 
 		 308 aa  311  1e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  49.68 
 
 		 308 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  50.99 
 
 		 306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  50.82 
 
 		 312 aa  285  5.999999999999999e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  47.23 
 
 		 308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  48.18 
 
 		 304 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  42.47 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  44.88 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  36.49 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  32.18 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  24.44 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  25.08 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  24.44 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  28.25 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  23.6 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  28.62 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  26.12 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.04 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  29.41 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  25.27 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  23.32 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  38.81 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1282  putative ribokinase  26.86 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.331017 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  29.52 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  25.77 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  26.21 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  28.32 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  29.2 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  23.96 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  26.3 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  27.74 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  26.95 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3268  PfkB domain protein  24.48 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.266121 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00450  expressed protein  26.53 
 
 		 436 aa  59.3  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.98204  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  28.26 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  27.05 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0338  rfaE bifunctional protein  24.92 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  33.87 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  26.53 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  25.48 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  26.84 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  25.9 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  25.91 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  26.69 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  40 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  27.78 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  32.24 
 
 		 342 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  25 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  27.34 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  27.34 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  28.4 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0487  ribokinase-like domain-containing protein  24 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  37.96 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  26 
 
 		 323 aa  57  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  26.54 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  25.61 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  27.62 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0417  ribokinase-like domain-containing protein  26.64 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994196  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1459  rfaE bifunctional protein  27.44 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  29.84 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  29.5 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00998  PfkB family carbohydrate kinase (Mak32), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12750)  22.75 
 
 		 372 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45308  ribokinase  30.33 
 
 		 709 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  26.67 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  26.67 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  26.23 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  26.67 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  24.67 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  28.46 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  36.72 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  25.25 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0349  putative ribokinase  26.64 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  27.94 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>