More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1357 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  100 
 
 		 303 aa  624  1e-178  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  88.41 
 
 		 303 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  84.72 
 
 		 303 aa  540  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  82.72 
 
 		 303 aa  534  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  82.39 
 
 		 303 aa  529  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  83.39 
 
 		 303 aa  527  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  80.4 
 
 		 303 aa  504  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  57.19 
 
 		 306 aa  368  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  55.18 
 
 		 305 aa  363  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  54.7 
 
 		 307 aa  362  5.0000000000000005e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  54.85 
 
 		 313 aa  360  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  53.85 
 
 		 318 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  53.18 
 
 		 305 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  53.85 
 
 		 304 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  54 
 
 		 305 aa  348  7e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  53.51 
 
 		 305 aa  347  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  53.51 
 
 		 305 aa  347  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  53.18 
 
 		 305 aa  346  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  53.51 
 
 		 307 aa  343  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  53.33 
 
 		 308 aa  338  7e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  50.83 
 
 		 306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  51.71 
 
 		 314 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  51.71 
 
 		 314 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  51.54 
 
 		 313 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  52 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  50.68 
 
 		 314 aa  319  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  50.17 
 
 		 312 aa  319  3e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  48.49 
 
 		 308 aa  311  1e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  48.22 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  45.18 
 
 		 304 aa  285  7e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  45.39 
 
 		 310 aa  276  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  43.43 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  40.48 
 
 		 302 aa  232  5e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  31.17 
 
 		 320 aa  175  7e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  28.75 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  26.54 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  23.34 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  27.56 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  23.57 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  27.5 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  25.84 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  25.84 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  26.09 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  28.21 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  25.48 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  25.16 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  39.06 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  23.64 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  25.08 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  25.97 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  25.18 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  26.5 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  22.88 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  26.41 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  26.03 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  23.79 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  34.88 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  24.44 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  23.25 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  25.09 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  24.05 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  24.64 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  28.26 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  28.26 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  28.26 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  24.28 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  28.26 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2634  ribokinase-like domain-containing protein  25.45 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.831919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  28.26 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  32.85 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  32.85 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  23.97 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  29.22 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  25.18 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  33.03 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  27.72 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  27.72 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  25.24 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  34.07 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2351  ribokinase-like domain-containing protein  26.21 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153207  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  27.21 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  34.11 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  25.97 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3683  adenosine kinase  23.83 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1158  ribokinase, putative  23.83 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  23.15 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  34.13 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  24.37 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  27.48 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  23.72 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  34.38 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0569  ribokinase-like domain-containing protein  23.1 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  decreased coverage  0.0000690864 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  27.08 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0117  adenosine kinase  23.1 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0600  adenosine kinase  23.1 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  31.21 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  28.8 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  26.2 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>