More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1525 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  100 
 
 		 303 aa  623  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  84.72 
 
 		 303 aa  540  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  83.17 
 
 		 303 aa  534  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  84.77 
 
 		 303 aa  533  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  84.11 
 
 		 303 aa  533  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  82.51 
 
 		 303 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  82.45 
 
 		 303 aa  523  1e-147  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  55.78 
 
 		 306 aa  368  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  55.63 
 
 		 305 aa  363  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  54.97 
 
 		 313 aa  363  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  54.36 
 
 		 307 aa  359  2e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  53.47 
 
 		 318 aa  358  7e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  53.97 
 
 		 304 aa  358  7e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  53.85 
 
 		 305 aa  357  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  54.33 
 
 		 305 aa  353  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  54.82 
 
 		 307 aa  353  2.9999999999999997e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  54 
 
 		 305 aa  352  5e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  53 
 
 		 306 aa  346  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  53.47 
 
 		 305 aa  345  4e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  52.51 
 
 		 305 aa  343  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  51.64 
 
 		 308 aa  340  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  52.67 
 
 		 306 aa  328  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  50.17 
 
 		 314 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  50.17 
 
 		 314 aa  324  9e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  51.16 
 
 		 313 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  49.83 
 
 		 314 aa  322  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  48.84 
 
 		 308 aa  318  5e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  49.17 
 
 		 312 aa  318  9e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  48.71 
 
 		 308 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  43.89 
 
 		 304 aa  285  5.999999999999999e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  44.88 
 
 		 310 aa  277  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  41.61 
 
 		 297 aa  248  9e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  39.86 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  30.65 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  27.83 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  27.83 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  27.33 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  24.83 
 
 		 308 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  26.58 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  24.81 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  35.66 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  24.81 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  25.87 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  29.74 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  26.1 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  21.6 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  24.91 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  24.18 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  23.81 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  26.67 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  24.52 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  26.28 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  35.2 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  21.95 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  23.62 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  28.3 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  34.48 
 
 		 403 aa  62.4  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  26.95 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75489  ribokinase  25.83 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  24.44 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  24.44 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  26.88 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  24.64 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  25.35 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  22.22 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  24.92 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  24 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  29.41 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  27.63 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  33.03 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  25.4 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  34.4 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  24.44 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  24.81 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  24.44 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  28.81 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  25.1 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  32.12 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  32.12 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  25.98 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  23.87 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  30.71 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  30.71 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  27.24 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  23.87 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  25.36 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  25.62 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  25.62 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  25.36 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  25.62 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  24.92 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  25.62 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  26.62 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  24.09 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  24.64 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  28.38 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  25.26 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  25.62 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  23.89 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  30 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>