More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5554 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  100 
 
 		 306 aa  633  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  76.82 
 
 		 305 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  68.52 
 
 		 306 aa  454  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  70.26 
 
 		 306 aa  456  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  60.86 
 
 		 307 aa  404  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  62.95 
 
 		 307 aa  405  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  61.89 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  54.43 
 
 		 308 aa  366  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  52.67 
 
 		 303 aa  341  9e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  52.33 
 
 		 303 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  52 
 
 		 303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  52.33 
 
 		 303 aa  334  1e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  53 
 
 		 303 aa  332  6e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  52.33 
 
 		 303 aa  332  7.000000000000001e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  51 
 
 		 303 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  50.99 
 
 		 318 aa  319  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  51.99 
 
 		 304 aa  316  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  49.67 
 
 		 313 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  49.01 
 
 		 305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  49.01 
 
 		 305 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  48.01 
 
 		 313 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  48.01 
 
 		 305 aa  295  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  48.68 
 
 		 305 aa  295  6e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  47.68 
 
 		 305 aa  293  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  47.02 
 
 		 314 aa  292  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  46.69 
 
 		 314 aa  291  9e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  48.17 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  46.36 
 
 		 314 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  48.05 
 
 		 308 aa  279  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  45.39 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  45.64 
 
 		 304 aa  269  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  40.2 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  37.63 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  30.19 
 
 		 320 aa  169  6e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  25.56 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  25.56 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  25.71 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  25.28 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  23.89 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  25.8 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  25.44 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  25.93 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  27.76 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  27.44 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  31.93 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  24.36 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  25.36 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  25.46 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  24.84 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  34.62 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  34.62 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  34.57 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  39.77 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  26.05 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  26.05 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  27.36 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  26.05 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  33.93 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  25.31 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  24.72 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  38.02 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  26.94 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  26.34 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  38.64 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  34.13 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  23.74 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  35.65 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  25.39 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  31.69 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  26.05 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  24.05 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  38.64 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  26.18 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  38.64 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  30.71 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  30.71 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  24.84 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45308  ribokinase  26.14 
 
 		 709 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394155  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  32.88 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  23.57 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  35.54 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  26.63 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  27.48 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  26.29 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  33.1 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  30.33 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  32.37 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  30.71 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  23.81 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  23.2 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  33.86 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  26.55 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  26.22 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  23.47 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  20.86 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  23.74 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  24.19 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3562  PfkB domain protein  26.9 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  32.17 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  24.68 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>