More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3606 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  100 
 
 		 305 aa  624  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  83.5 
 
 		 305 aa  534  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  76.49 
 
 		 313 aa  498  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  77.48 
 
 		 304 aa  495  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  76.57 
 
 		 305 aa  490  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  73.27 
 
 		 305 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  72.61 
 
 		 305 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  61.26 
 
 		 314 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  60.93 
 
 		 314 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  60.93 
 
 		 314 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  60.6 
 
 		 313 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  53.51 
 
 		 303 aa  350  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  53.14 
 
 		 303 aa  349  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  53.51 
 
 		 303 aa  347  2e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  52.51 
 
 		 303 aa  343  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  52.84 
 
 		 303 aa  341  1e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  51.84 
 
 		 303 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  52.51 
 
 		 303 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  52.16 
 
 		 312 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  52 
 
 		 307 aa  325  5e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  51.33 
 
 		 307 aa  318  9e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  51.47 
 
 		 308 aa  316  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  50.66 
 
 		 318 aa  316  4e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  50.5 
 
 		 304 aa  307  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  49 
 
 		 308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  48.84 
 
 		 308 aa  305  9.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  48.51 
 
 		 305 aa  302  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  48.84 
 
 		 306 aa  302  6.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  47.02 
 
 		 306 aa  295  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  47.37 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  48.68 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  42.76 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  42.66 
 
 		 302 aa  244  9e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  31.82 
 
 		 320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  27.07 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  25.7 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  22.97 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  27.65 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  27.19 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  35.9 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  27.9 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  29.41 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  41.94 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  26.27 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  32.74 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  25.98 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  29.17 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  29.17 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  36.28 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  26.47 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  31.25 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  23.92 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  32.61 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  23.71 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  32.31 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  32.31 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  32.31 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  32.31 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  32.31 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  33.87 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  25.71 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  26.17 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  28.48 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  26.17 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  26.17 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  24.09 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  24.09 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  24.09 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  26.44 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  24.09 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  28.19 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  27.18 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  24.4 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3268  PfkB domain protein  31.62 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.266121 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  29.86 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  35.29 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  30.54 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  31.36 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  29.7 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  31.36 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  32.31 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  31.09 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  32.31 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  29.6 
 
 		 348 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1282  putative ribokinase  27.34 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.331017 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  25.6 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  21.22 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  26.58 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  25.53 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  33.33 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  26.35 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  26.32 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  25.29 
 
 		 314 aa  53.1  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  25.29 
 
 		 314 aa  53.1  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  35.71 
 
 		 407 aa  53.5  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  43.21 
 
 		 333 aa  53.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  20.95 
 
 		 322 aa  53.1  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  25.29 
 
 		 314 aa  53.1  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>