More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3268 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3268  PfkB domain protein  100 
 
 		 297 aa  619  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.266121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  63.99 
 
 		 306 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  55.43 
 
 		 285 aa  332  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0505  ribokinase-like domain-containing protein  30.93 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000868793  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3082  PfkB domain protein  30.95 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.925823  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2948  ribokinase-like domain-containing protein  30.91 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.64332 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1424  PfkB domain protein  29.35 
 
 		 285 aa  86.3  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  32.14 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2985  carbohydrate kinase, PfkB  27.89 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0222551  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3183  PfkB domain protein  28.97 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  33.18 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0143  ribokinase-like domain-containing protein  25.09 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000113671  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  31.61 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0047  carbohydrate kinase  37.29 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  34.13 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  32.46 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0209  PfkB  34.78 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  23.47 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  32.79 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  41.33 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  34.21 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  38.38 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  25.52 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  33.61 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  33.05 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  33.05 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  33.9 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  33.05 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  33.05 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  33.05 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  33.05 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3635  ribokinase-like domain-containing protein  35.53 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2945  PfkB domain protein  35.53 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  26.22 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  29.17 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1200  PfkB domain protein  25.68 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.460127  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  31.34 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  33.33 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  27.21 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  34.65 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  24.48 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  25.36 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3935  PfkB  34.34 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0713343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  37.5 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  41.33 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  30.08 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  41.33 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  31.5 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  31.17 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  30.23 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  29.2 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  28.96 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  27.43 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  31.03 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  33.06 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  31.9 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  40 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  34.62 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  33.65 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  30.63 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  22.15 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  32.54 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  35.09 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  32.54 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  33.9 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  26.5 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  32.2 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  31.68 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  32.31 
 
 		 380 aa  57  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  40.7 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  29.81 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  32.69 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  22.65 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  22.65 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  31.62 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  25.74 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  34.62 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  24.68 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2634  ribokinase-like domain-containing protein  36.84 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.831919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  26.15 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2067  Adenosine kinase  35.05 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  23.55 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  24.81 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  25.8 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  30.36 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  33.83 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  33.6 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  30.36 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  22.92 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  30.89 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  30.77 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  35.71 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  23.23 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  36.84 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  36.84 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  36.7 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  31.53 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>