More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3699 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  100 
 
 		 306 aa  625  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  69.08 
 
 		 306 aa  457  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  68.52 
 
 		 306 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  67.21 
 
 		 305 aa  435  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  64.69 
 
 		 307 aa  414  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  65.35 
 
 		 307 aa  412  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  61.44 
 
 		 308 aa  398  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  54.13 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  53 
 
 		 303 aa  346  3e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  50.83 
 
 		 303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  52.63 
 
 		 303 aa  334  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  50.67 
 
 		 303 aa  334  1e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  50.17 
 
 		 303 aa  333  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  50.33 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  51 
 
 		 303 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  49 
 
 		 303 aa  315  6e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  50.33 
 
 		 304 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  48.34 
 
 		 305 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  46.69 
 
 		 313 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  48.01 
 
 		 313 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  46.03 
 
 		 314 aa  305  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  45.7 
 
 		 314 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  45.7 
 
 		 314 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  48.01 
 
 		 305 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  48.01 
 
 		 305 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  47.68 
 
 		 305 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  47.02 
 
 		 305 aa  295  5e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  46.75 
 
 		 308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  44.52 
 
 		 312 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  44.33 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  40.91 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  41 
 
 		 297 aa  242  5e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  39.06 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  29.32 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  25.71 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  25.86 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  27.68 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  25.52 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  24.91 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  23.61 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  23.61 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  26.13 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  25.26 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  25.23 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  24.36 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  23.26 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  23.61 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  23.26 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  23.26 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  33.57 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  23.26 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  22.14 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  36.11 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  33.61 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  24.7 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  24.48 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  38.64 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  27.21 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  38.64 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  25.44 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  33.54 
 
 		 398 aa  62.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  24.69 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  37.5 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  33.06 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  24.59 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  32.84 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  26.78 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  35.23 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  24.67 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  24.52 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  23.31 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  31.25 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  25.12 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  23.43 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  23.37 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  25.19 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  29.32 
 
 		 403 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  32.82 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  32.95 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  21.32 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  23.73 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  32.95 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  21.27 
 
 		 301 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  24.48 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3268  PfkB domain protein  22.15 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.266121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  25.63 
 
 		 325 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  32.95 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  24.52 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00998  PfkB family carbohydrate kinase (Mak32), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12750)  23.75 
 
 		 372 aa  57  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  34.06 
 
 		 404 aa  57  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  24.81 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  24 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  24.62 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  31.97 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  30.82 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  28.35 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  24.83 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  22.65 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  31.25 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>