More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3036 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  99.04 
 
 
311 aa  635    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  100 
 
 
311 aa  644    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  91.64 
 
 
311 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  77.39 
 
 
315 aa  520  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  75.56 
 
 
315 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  62.15 
 
 
319 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  61.76 
 
 
319 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  65.06 
 
 
312 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3683  adenosine kinase  64.1 
 
 
312 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235022  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  64.42 
 
 
312 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3506  sugar kinase  64.08 
 
 
312 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1158  ribokinase, putative  63.55 
 
 
312 aa  411  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3470  PfkB family kinase  64.08 
 
 
312 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0117  adenosine kinase  63.78 
 
 
312 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0569  ribokinase-like domain-containing protein  63.78 
 
 
312 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  decreased coverage  0.0000690864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  63.78 
 
 
320 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0600  adenosine kinase  63.78 
 
 
312 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3508  PfkB family kinase  64.08 
 
 
312 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1286  putative ribokinase  63.75 
 
 
312 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0427  putative ribokinase  63.75 
 
 
312 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3278  putative ribokinase  63.75 
 
 
312 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  62.78 
 
 
312 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  63.11 
 
 
312 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2067  Adenosine kinase  59.35 
 
 
310 aa  401  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2634  ribokinase-like domain-containing protein  62.46 
 
 
314 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.831919  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  59.35 
 
 
310 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3935  PfkB  59.93 
 
 
310 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0713343  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3455  PfkB domain protein  58.77 
 
 
312 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327587  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04263  sugar kinase  59.09 
 
 
362 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.383154  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0047  carbohydrate kinase  57.1 
 
 
310 aa  376  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2548  carbohydrate kinase, PfkB  55.66 
 
 
310 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636589  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0209  PfkB  57.28 
 
 
311 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3388  ribokinase-like domain-containing protein  58.53 
 
 
307 aa  371  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.684995 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  58.25 
 
 
310 aa  368  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  55.23 
 
 
320 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3635  ribokinase-like domain-containing protein  58.02 
 
 
298 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1103  PfkB  58.02 
 
 
300 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00948504  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2945  PfkB domain protein  57.34 
 
 
298 aa  364  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  54.07 
 
 
316 aa  362  6e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  56.35 
 
 
311 aa  359  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2506  ribokinase, putative  62.14 
 
 
283 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.617052  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1493  ribokinase-like domain-containing protein  54.95 
 
 
298 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  53.07 
 
 
313 aa  349  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  53.07 
 
 
313 aa  349  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0953  PfkB domain protein  54.98 
 
 
300 aa  348  5e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0861  ribokinase-like domain-containing protein  53.58 
 
 
298 aa  341  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.035179  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1498  ribokinase-like domain-containing protein  52.54 
 
 
300 aa  339  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3210  putative sugar kinase transferase protein  53.08 
 
 
301 aa  329  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258809  decreased coverage  0.003878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0386  ribokinase-like domain-containing protein  53.67 
 
 
302 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  43.51 
 
 
327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0487  ribokinase-like domain-containing protein  41.56 
 
 
327 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3562  PfkB domain protein  41.61 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0800  ribokinase-like domain-containing protein  40.26 
 
 
312 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2351  ribokinase-like domain-containing protein  39.74 
 
 
318 aa  225  9e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153207  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  38.51 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  40.45 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  39.61 
 
 
308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  40.26 
 
 
308 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3120  adenosine kinase  35.78 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3081  PfkB domain protein  34.71 
 
 
324 aa  195  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2947  adenosine kinase  35.03 
 
 
323 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3566  adenosine kinase  33.97 
 
 
323 aa  193  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0415989  normal  0.0392481 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12230  carbohydrate kinase cbhK  34.94 
 
 
324 aa  192  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000530804  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3257  Adenosine kinase  35.58 
 
 
325 aa  189  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00285447  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3063  PfkB domain protein  34.62 
 
 
324 aa  188  9e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142988  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1012  putative carbohydrate kinase  35.56 
 
 
324 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1286  PfkB domain-containing protein  34.52 
 
 
328 aa  185  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1798  adenosine kinase  34.19 
 
 
326 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3311  adenosine kinase  32.91 
 
 
324 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353965  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3300  adenosine kinase  32.91 
 
 
324 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3362  adenosine kinase  32.91 
 
 
324 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1665  Adenosine kinase  34.07 
 
 
329 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3153  Adenosine kinase  33.23 
 
 
323 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0955  ribokinase-like domain-containing protein  35.02 
 
 
339 aa  176  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.989352  normal  0.38603 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1531  PfkB domain protein  33.86 
 
 
329 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3294  PfkB domain protein  34.39 
 
 
325 aa  175  9e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27030  sugar kinase, ribokinase  32.69 
 
 
321 aa  175  9e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.364358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2666  PfkB domain protein  34.09 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3144  ribokinase-like domain-containing protein  31.95 
 
 
327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3303  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
325 aa  169  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3535  ribokinase-like domain-containing protein  32.38 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32323  decreased coverage  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4145  PfkB domain-containing protein  31.21 
 
 
327 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786211  decreased coverage  0.0063394 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  32.23 
 
 
298 aa  137  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  33.71 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  34.47 
 
 
302 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  32.62 
 
 
302 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  33.59 
 
 
302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.38 
 
 
299 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.81 
 
 
300 aa  102  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  28.47 
 
 
317 aa  96.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  31.62 
 
 
299 aa  95.9  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  29.2 
 
 
294 aa  86.3  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0932  inosine-guanosine kinase / cytidine kinase  26.77 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.934328  normal  0.0821037 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1658  ribokinase-like domain-containing protein  26.4 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.468132  normal  0.0440332 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  26.8 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  29.1 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  29.07 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  24.44 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  29.92 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  29.92 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>