More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0180 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
302 aa  620  1e-177  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  44.63 
 
 
304 aa  267  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  42.28 
 
 
313 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  43 
 
 
305 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  42.66 
 
 
305 aa  260  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  41.64 
 
 
305 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  40.27 
 
 
314 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  40.27 
 
 
314 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  41.61 
 
 
305 aa  249  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  41.61 
 
 
305 aa  248  8e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  41.72 
 
 
312 aa  247  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  40.48 
 
 
303 aa  247  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  40.62 
 
 
314 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  41.55 
 
 
303 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  39.86 
 
 
303 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  40.54 
 
 
303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  40.48 
 
 
303 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  38.1 
 
 
313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  39.8 
 
 
303 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  39.8 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  38 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  39.06 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  39.67 
 
 
308 aa  229  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  36.88 
 
 
306 aa  225  6e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  40.4 
 
 
308 aa  225  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  38.26 
 
 
297 aa  223  4e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  36.96 
 
 
307 aa  223  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  39.32 
 
 
305 aa  223  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  36.49 
 
 
318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  35.81 
 
 
304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  34.77 
 
 
308 aa  207  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  34.67 
 
 
310 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  37.63 
 
 
306 aa  202  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  32.04 
 
 
320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  27.68 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  29.43 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  25.44 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  25.95 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  25.6 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  27.61 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  24.37 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  25.65 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  25 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  26.69 
 
 
302 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  26.96 
 
 
307 aa  63.5  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  31.29 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  25.86 
 
 
317 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  24.85 
 
 
308 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  38.1 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  25.74 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3268  PfkB domain protein  24.6 
 
 
297 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.266121 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  36.56 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  25.94 
 
 
344 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  25.49 
 
 
315 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  33.82 
 
 
302 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  25.56 
 
 
310 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  28.95 
 
 
308 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  26.76 
 
 
315 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  25.56 
 
 
310 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  26.04 
 
 
315 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  25.09 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  26.04 
 
 
315 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  42.53 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  32.35 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  25.78 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  25.7 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  26.06 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  33.33 
 
 
338 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  26.06 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  23.26 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  27.3 
 
 
306 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  26.88 
 
 
334 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  24.91 
 
 
310 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  28.03 
 
 
319 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  27.05 
 
 
336 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  26.32 
 
 
321 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0252  PfkB domain protein  38.46 
 
 
283 aa  56.2  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  32.12 
 
 
310 aa  56.2  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  36.56 
 
 
322 aa  56.2  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  27.54 
 
 
306 aa  56.2  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  26.91 
 
 
364 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  24.83 
 
 
315 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  25.35 
 
 
312 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  25.44 
 
 
315 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  26.3 
 
 
308 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  31.3 
 
 
314 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  39.53 
 
 
403 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  37.23 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  36.27 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4487  carbohydrate kinase, PfkB  25.11 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  26.19 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  32.14 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  25.76 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  29 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  24.31 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  33.33 
 
 
308 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  33.33 
 
 
308 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  33.33 
 
 
308 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
308 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  29.84 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>