More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1382 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  100 
 
 		 303 aa  625  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  82.45 
 
 		 303 aa  523  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  79.73 
 
 		 303 aa  504  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  80.4 
 
 		 303 aa  504  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  77.56 
 
 		 303 aa  503  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  80.13 
 
 		 303 aa  498  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  77.15 
 
 		 303 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  55.45 
 
 		 306 aa  365  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  55.15 
 
 		 307 aa  363  2e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  54.18 
 
 		 318 aa  354  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  54.82 
 
 		 307 aa  353  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  53.14 
 
 		 305 aa  352  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  52.81 
 
 		 305 aa  350  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  53.47 
 
 		 313 aa  350  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  54 
 
 		 308 aa  348  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  52.48 
 
 		 304 aa  347  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  52.81 
 
 		 305 aa  343  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  53.14 
 
 		 305 aa  343  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  51.51 
 
 		 305 aa  343  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  51.84 
 
 		 305 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  50.67 
 
 		 306 aa  334  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  50.33 
 
 		 314 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  50 
 
 		 314 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  50.5 
 
 		 312 aa  328  5.0000000000000004e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  50 
 
 		 314 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  49.34 
 
 		 308 aa  326  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  50 
 
 		 313 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  52.33 
 
 		 306 aa  322  5e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  44.37 
 
 		 304 aa  285  5.999999999999999e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  45.81 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  42.9 
 
 		 310 aa  270  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  41.61 
 
 		 297 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  40.54 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  30.19 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  27.51 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  29.5 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  22.65 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  27.3 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  25.64 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  24.33 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  24.76 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  25.25 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  29.27 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  24.09 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  21.88 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  25.46 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  25 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  26.43 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  29.84 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  37.4 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  26.07 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  26.07 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  26.07 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  26.07 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  27.51 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  23.62 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  28.95 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  26.8 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  25.71 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  25.71 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  23.42 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  23.94 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  23.4 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  30.51 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  23.94 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  25.8 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  26 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  24.16 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  24.47 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  39.6 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  31.82 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  24.45 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  30.14 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.6 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  30.47 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0117  adenosine kinase  31.43 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  24.48 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0600  adenosine kinase  31.43 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  30.3 
 
 		 636 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0569  ribokinase-like domain-containing protein  31.43 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  decreased coverage  0.0000690864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  25.09 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  35.51 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0983  PfkB domain protein  27.63 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  34.43 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  39.6 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  25.47 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  32.77 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  33.88 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  25.35 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  26.33 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  25.09 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0955  ribokinase-like domain-containing protein  23.94 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.989352  normal  0.38603 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  24.07 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  26.14 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  31.36 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  23.51 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  26.36 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  38.61 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  23.43 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>