More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03165 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  100 
 
 		 307 aa  627  1e-179  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  80.13 
 
 		 307 aa  508  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  69.74 
 
 		 306 aa  451  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  65.15 
 
 		 308 aa  439  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  66.67 
 
 		 305 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  65.35 
 
 		 306 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  61.64 
 
 		 308 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  62.95 
 
 		 306 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  55.15 
 
 		 303 aa  363  2e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  54.7 
 
 		 303 aa  362  5.0000000000000005e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  54.36 
 
 		 303 aa  359  2e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  55.67 
 
 		 303 aa  359  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  54.85 
 
 		 303 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  53.69 
 
 		 303 aa  355  5e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  52.82 
 
 		 303 aa  349  4e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  55 
 
 		 304 aa  344  8.999999999999999e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  50 
 
 		 318 aa  342  4e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  52.82 
 
 		 305 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  54 
 
 		 305 aa  334  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  53.67 
 
 		 313 aa  333  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  52.49 
 
 		 305 aa  332  4e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  52.33 
 
 		 305 aa  330  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  52 
 
 		 305 aa  325  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  47.33 
 
 		 313 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  47.49 
 
 		 314 aa  301  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  47.49 
 
 		 314 aa  301  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  47.84 
 
 		 312 aa  301  8.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  47.16 
 
 		 314 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  47.32 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  46.58 
 
 		 308 aa  285  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  46.03 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  43.14 
 
 		 297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  38 
 
 		 302 aa  221  9e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  33.01 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  26.27 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  25.09 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  26.42 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  25.4 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  25.17 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  26.63 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  24.68 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  24.68 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  26.35 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  35.25 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  25.7 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0922  ribokinase-like domain-containing protein  25.29 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  24.92 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  37.31 
 
 		 403 aa  65.9  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  25.23 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  24.75 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  23.78 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  24.08 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  23.84 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  24.41 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  25.91 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  24.41 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.09 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  22.83 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  24.08 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  30.43 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1285  D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  26.02 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.541266 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  25.09 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  26.76 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  24.52 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  34.04 
 
 		 403 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  25.66 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  31.79 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  26.67 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  25.32 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  25.85 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  21.51 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  24.38 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  32.37 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  26.47 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  22.38 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  24.14 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  25.91 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  26.54 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  25.08 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  24.03 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  24 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1282  putative ribokinase  22.73 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.331017 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  25.65 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  32.76 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  25.65 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  34.09 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  21.46 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  30.3 
 
 		 308 aa  57  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  28.23 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  28.23 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  33.04 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  28.23 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  35.83 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  26.96 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  31.36 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  24.28 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  30.43 
 
 		 330 aa  57  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  25.08 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  29.91 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>