More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2625 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  100 
 
 
308 aa  632  1e-180  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  52.27 
 
 
305 aa  326  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  52.27 
 
 
305 aa  326  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  52.27 
 
 
304 aa  325  5e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  51.3 
 
 
305 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  51.3 
 
 
313 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  50.81 
 
 
305 aa  318  9e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  51.47 
 
 
305 aa  316  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  50.97 
 
 
313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  50.65 
 
 
314 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  50 
 
 
314 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  50 
 
 
314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  50.65 
 
 
303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  48.22 
 
 
303 aa  300  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  48.71 
 
 
303 aa  300  3e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  48.54 
 
 
303 aa  297  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  49.35 
 
 
303 aa  296  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  47.25 
 
 
307 aa  291  7e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  48.87 
 
 
306 aa  291  8e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  48.87 
 
 
305 aa  286  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  46.77 
 
 
303 aa  285  7e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  48.05 
 
 
312 aa  285  7e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  46.58 
 
 
307 aa  285  8e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  45.81 
 
 
303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  47.23 
 
 
318 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  46.75 
 
 
306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  48.05 
 
 
304 aa  278  9e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  48.05 
 
 
306 aa  264  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  46.13 
 
 
310 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  43.91 
 
 
308 aa  260  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  43.23 
 
 
308 aa  251  8.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  39.74 
 
 
297 aa  233  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  39.67 
 
 
302 aa  215  8e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  32.26 
 
 
320 aa  179  7e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  25.08 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  24.84 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  24.53 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  24.21 
 
 
302 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  23.35 
 
 
298 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3508  PfkB family kinase  32.45 
 
 
312 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3506  sugar kinase  32.45 
 
 
312 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  34.31 
 
 
314 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3470  PfkB family kinase  32.45 
 
 
312 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  31.62 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2351  ribokinase-like domain-containing protein  26.01 
 
 
318 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153207  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1158  ribokinase, putative  31.79 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45308  ribokinase  27.08 
 
 
709 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3278  putative ribokinase  32.45 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0427  putative ribokinase  32.45 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1286  putative ribokinase  32.45 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2506  ribokinase, putative  32.45 
 
 
283 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.617052  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  25 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  27.18 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  26.52 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  30.94 
 
 
320 aa  57  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  33.33 
 
 
309 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  40 
 
 
296 aa  57.4  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0487  ribokinase-like domain-containing protein  25.68 
 
 
327 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  25.2 
 
 
327 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  34.33 
 
 
313 aa  57  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  30.67 
 
 
312 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  30.67 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  31.33 
 
 
312 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  35.2 
 
 
283 aa  55.8  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  35.79 
 
 
315 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0932  inosine-guanosine kinase / cytidine kinase  24.39 
 
 
298 aa  55.8  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.934328  normal  0.0821037 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  35.79 
 
 
315 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  31.4 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  25.4 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  34.31 
 
 
403 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  23.83 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  31.03 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  32.41 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  27.81 
 
 
313 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  27.81 
 
 
313 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  27.81 
 
 
313 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  33.85 
 
 
317 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  24.65 
 
 
299 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3257  Adenosine kinase  25.51 
 
 
325 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00285447  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  35.77 
 
 
293 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0569  ribokinase-like domain-containing protein  31.51 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  decreased coverage  0.0000690864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  26.11 
 
 
325 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0117  adenosine kinase  31.51 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2294  ribokinase-like domain-containing protein  30.16 
 
 
317 aa  53.5  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0600  adenosine kinase  31.51 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  29.87 
 
 
337 aa  53.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3683  adenosine kinase  30.92 
 
 
312 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235022  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  25.62 
 
 
301 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  26.23 
 
 
315 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  30.68 
 
 
304 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  24.15 
 
 
318 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  24.56 
 
 
311 aa  52.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  37.89 
 
 
319 aa  53.1  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  32.65 
 
 
313 aa  52.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  31.58 
 
 
313 aa  52.8  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  42.17 
 
 
297 aa  52.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  33.88 
 
 
298 aa  52.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  30.82 
 
 
312 aa  52.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  34.35 
 
 
334 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  25.68 
 
 
314 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>