More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2316 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  100 
 
 
314 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  99.36 
 
 
314 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  96.18 
 
 
314 aa  607  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  82.69 
 
 
313 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  63.33 
 
 
305 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  63 
 
 
305 aa  401  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  60.7 
 
 
313 aa  391  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  59.6 
 
 
304 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  60.6 
 
 
305 aa  388  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  61.18 
 
 
305 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  60.93 
 
 
305 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  56.29 
 
 
312 aa  338  5.9999999999999996e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  50 
 
 
303 aa  330  3e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  51.71 
 
 
303 aa  328  9e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  50.17 
 
 
303 aa  325  5e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  50.83 
 
 
303 aa  325  6e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  50.99 
 
 
303 aa  325  9e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  52.74 
 
 
303 aa  324  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  53.48 
 
 
318 aa  323  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  49.17 
 
 
306 aa  314  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  49.01 
 
 
303 aa  310  2e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  48.17 
 
 
307 aa  307  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  49.5 
 
 
305 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  46.03 
 
 
306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  50 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  47.49 
 
 
307 aa  301  6.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  47.84 
 
 
308 aa  300  1e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  48.36 
 
 
308 aa  300  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  50.17 
 
 
304 aa  281  8.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  47.7 
 
 
310 aa  279  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  47.02 
 
 
306 aa  278  9e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  40.74 
 
 
297 aa  266  4e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  40.27 
 
 
302 aa  237  2e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  31.94 
 
 
320 aa  160  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  28.52 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  27.27 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  27.22 
 
 
325 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  37.7 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  38.64 
 
 
329 aa  61.6  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  24.03 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  41.86 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2294  ribokinase-like domain-containing protein  31.21 
 
 
317 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  41.86 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  26.09 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  22.18 
 
 
306 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  31.48 
 
 
315 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  31.48 
 
 
315 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  31.48 
 
 
315 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  37.62 
 
 
314 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4553  ribokinase-like domain-containing protein  36.43 
 
 
311 aa  60.1  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  33.59 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  29.03 
 
 
305 aa  60.1  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  31.48 
 
 
315 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  31.48 
 
 
315 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  31.48 
 
 
315 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  31.48 
 
 
315 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  37.62 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  25.97 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  31.36 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  26.67 
 
 
325 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  29.31 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.1 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  24.34 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  35.87 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  26.6 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  27.92 
 
 
301 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  35.38 
 
 
424 aa  57.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  31.03 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  31.54 
 
 
338 aa  57  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  32.82 
 
 
319 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  25.45 
 
 
317 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  24.29 
 
 
312 aa  56.6  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  23.01 
 
 
310 aa  56.6  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  23.62 
 
 
285 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  28.35 
 
 
338 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  31.86 
 
 
330 aa  56.2  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  31.86 
 
 
330 aa  56.2  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  29.52 
 
 
302 aa  56.2  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  23.53 
 
 
322 aa  56.2  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  30.77 
 
 
294 aa  56.2  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  29.69 
 
 
337 aa  55.8  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  33.85 
 
 
634 aa  55.8  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  29.09 
 
 
311 aa  55.8  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  26.47 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  31.43 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  32.26 
 
 
317 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  26.76 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  25.13 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  31.67 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  30.83 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  43.48 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  27.27 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  28.81 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  38.2 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  31.67 
 
 
302 aa  54.3  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  26.09 
 
 
333 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  36.36 
 
 
333 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  26.89 
 
 
304 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  31.67 
 
 
302 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  27.99 
 
 
300 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>