More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0962 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  100 
 
 		 308 aa  638    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  65.15 
 
 		 307 aa  439  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  64.17 
 
 		 307 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  57.76 
 
 		 305 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  55.92 
 
 		 306 aa  380  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  56.72 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  54.13 
 
 		 306 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  54.43 
 
 		 306 aa  358  7e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  49.34 
 
 		 303 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  48.84 
 
 		 303 aa  318  5e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  49.5 
 
 		 303 aa  317  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  50.17 
 
 		 303 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  49.67 
 
 		 303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  48.49 
 
 		 303 aa  311  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  47.84 
 
 		 318 aa  311  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  49.33 
 
 		 305 aa  308  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  49 
 
 		 305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  47.84 
 
 		 305 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  46.84 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  48.17 
 
 		 313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  48.17 
 
 		 314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  48.01 
 
 		 313 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  47.51 
 
 		 305 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  47.84 
 
 		 314 aa  301  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  47.84 
 
 		 314 aa  300  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  46.03 
 
 		 303 aa  300  3e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  46.51 
 
 		 305 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  46.53 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  44.19 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  43.23 
 
 		 308 aa  251  8.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  38.67 
 
 		 297 aa  248  9e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  40.92 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  34.77 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 320 aa  186  6e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  27.38 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  26.3 
 
 		 308 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  24.91 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  34.92 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  30.19 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  27.39 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  25.5 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  30.19 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  30.19 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  30.19 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  30.19 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  30.19 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  38.1 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  30.19 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  25.87 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  25.63 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  23.82 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  27.93 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  36.8 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  24.21 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  33.71 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  25.91 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  29.85 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  37.06 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  23.68 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  22.73 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  26.02 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  26.42 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  25.41 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  31.11 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  31.11 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  24.22 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  22.94 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  24.63 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  24.12 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  27.08 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  27.45 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  29.56 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  23.66 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  24.55 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  35.11 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  31.3 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  23.51 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  22.12 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  25.25 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  25.27 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  24.13 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  25.66 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  37.93 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  22.12 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  28.69 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  28.69 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  33.68 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  28.69 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  26.88 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  25.18 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  24.92 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  23.53 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  22.14 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  27.51 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  32.2 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  25.24 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  26.94 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  24.43 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>