More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2140 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  100 
 
 
302 aa  606  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  59.53 
 
 
308 aa  383  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  30.74 
 
 
315 aa  93.2  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  30.73 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  27.56 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3268  PfkB domain protein  33.18 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.266121 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  26.1 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  27.43 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  27.3 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  27.07 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  25.57 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  27.51 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  28.93 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  28.19 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  27.97 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  24.44 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  24.22 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  27.84 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  26.35 
 
 
320 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  25.08 
 
 
307 aa  62.8  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  26.67 
 
 
303 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  25.18 
 
 
302 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  46.58 
 
 
302 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  27.75 
 
 
360 aa  62.4  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  46.58 
 
 
302 aa  62.4  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  26.77 
 
 
303 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  45.21 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  25.17 
 
 
403 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  23.42 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  23.18 
 
 
404 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  26.84 
 
 
318 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  31.06 
 
 
316 aa  60.1  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  25.09 
 
 
306 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  25.09 
 
 
306 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  25.09 
 
 
306 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  25.09 
 
 
306 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  25.09 
 
 
306 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  24.92 
 
 
331 aa  59.7  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  24.22 
 
 
308 aa  59.7  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  27.31 
 
 
307 aa  59.7  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  26.42 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2666  PfkB domain protein  27.68 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  25.82 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  43.84 
 
 
298 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  24.91 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  24.91 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  24.91 
 
 
628 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  30.14 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  42.31 
 
 
304 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1286  PfkB domain-containing protein  27.27 
 
 
328 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  29.43 
 
 
308 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  27.86 
 
 
320 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  27.06 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  26.45 
 
 
363 aa  57.4  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  27.86 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  37.96 
 
 
319 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1012  putative carbohydrate kinase  28.68 
 
 
324 aa  56.6  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  27.55 
 
 
308 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  28.52 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  28.78 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  23.59 
 
 
372 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  23.59 
 
 
372 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  25.73 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  24.73 
 
 
424 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  26.99 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  28.41 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  28.92 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  26.1 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  22.12 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  39.53 
 
 
314 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3144  ribokinase-like domain-containing protein  30.55 
 
 
327 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  23.77 
 
 
628 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4655  ribokinase  34.78 
 
 
319 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.557505 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  25.09 
 
 
298 aa  53.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  35.05 
 
 
327 aa  53.1  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  29.46 
 
 
328 aa  53.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  35.48 
 
 
305 aa  53.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0922  ribokinase-like domain-containing protein  26.84 
 
 
289 aa  53.1  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  24.92 
 
 
317 aa  53.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  34.55 
 
 
305 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1429  ribokinase-like domain-containing protein  28.19 
 
 
272 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  24.28 
 
 
322 aa  52.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  23.75 
 
 
307 aa  52.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  35.48 
 
 
305 aa  52.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  28.28 
 
 
310 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  28.28 
 
 
310 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27030  sugar kinase, ribokinase  28.77 
 
 
321 aa  52.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.364358 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  28.28 
 
 
344 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  31.25 
 
 
308 aa  52.4  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  25.17 
 
 
313 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  23.45 
 
 
307 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  22.68 
 
 
326 aa  51.6  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  27.55 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  36.44 
 
 
308 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  23.77 
 
 
404 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  23.77 
 
 
404 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3309  PfkB domain protein  25.77 
 
 
325 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  34.26 
 
 
308 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1272  putative ribokinase  36.64 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0725613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  23.77 
 
 
404 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>