38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0922 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0922  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 289 aa  598  1e-170  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  23.77 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  25.29 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2948  ribokinase-like domain-containing protein  23.14 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.64332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  23.15 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  25.28 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0398  ribokinase-like domain-containing protein  22.84 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.688788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  23.28 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  26.75 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  22.78 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  26.07 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  26.84 
 
 		 302 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0505  ribokinase-like domain-containing protein  24.29 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000868793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  22.78 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  23.84 
 
 		 313 aa  46.6  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  23.85 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1200  PfkB domain protein  22.8 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.460127  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  24.32 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  23.63 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0159  hypothetical protein  23.19 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0236775 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  29.17 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  29.17 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45308  ribokinase  29.9 
 
 		 709 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  23.99 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3268  PfkB domain protein  22.55 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.266121 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  25.56 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  23.22 
 
 		 404 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  24.9 
 
 		 404 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  23.22 
 
 		 404 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  23.22 
 
 		 404 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  23.22 
 
 		 404 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  23.22 
 
 		 404 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1734  ribokinase-like domain-containing protein  23.17 
 
 		 281 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.264913  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  28.1 
 
 		 344 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 326 aa  42.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  23.92 
 
 		 297 aa  42.4  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1424  PfkB domain protein  21.9 
 
 		 285 aa  42  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  25.2 
 
 		 317 aa  42.4  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>