More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3635 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3635  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2945  PfkB domain protein  98.99 
 
 		 298 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0861  ribokinase-like domain-containing protein  81.14 
 
 		 298 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.035179  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1493  ribokinase-like domain-containing protein  78.64 
 
 		 298 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1498  ribokinase-like domain-containing protein  75.33 
 
 		 300 aa  471  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0953  PfkB domain protein  75 
 
 		 300 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3388  ribokinase-like domain-containing protein  73.22 
 
 		 307 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.684995 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1103  PfkB  73.38 
 
 		 300 aa  454  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00948504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3210  putative sugar kinase transferase protein  68.47 
 
 		 301 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258809  decreased coverage  0.003878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0386  ribokinase-like domain-containing protein  66.55 
 
 		 302 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477103 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  58.7 
 
 		 311 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  60.54 
 
 		 312 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  58.02 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  59.86 
 
 		 320 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  60.88 
 
 		 312 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  60.96 
 
 		 312 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  55.63 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2634  ribokinase-like domain-containing protein  61.3 
 
 		 314 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.831919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  56.77 
 
 		 319 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  57.68 
 
 		 311 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  59.93 
 
 		 312 aa  361  8e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1158  ribokinase, putative  57.88 
 
 		 312 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3506  sugar kinase  57.53 
 
 		 312 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3470  PfkB family kinase  57.53 
 
 		 312 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3508  PfkB family kinase  57.53 
 
 		 312 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3278  putative ribokinase  57.19 
 
 		 312 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0427  putative ribokinase  57.19 
 
 		 312 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1286  putative ribokinase  57.19 
 
 		 312 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  56.23 
 
 		 315 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  56.95 
 
 		 315 aa  352  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2067  Adenosine kinase  53.58 
 
 		 310 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3683  adenosine kinase  57.48 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  52.04 
 
 		 310 aa  346  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0117  adenosine kinase  56.8 
 
 		 312 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0600  adenosine kinase  56.8 
 
 		 312 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0569  ribokinase-like domain-containing protein  56.8 
 
 		 312 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  decreased coverage  0.0000690864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3935  PfkB  56.16 
 
 		 310 aa  341  7e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0713343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  53.74 
 
 		 316 aa  341  8e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  56.7 
 
 		 311 aa  341  8e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0047  carbohydrate kinase  53.72 
 
 		 310 aa  340  2e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2548  carbohydrate kinase, PfkB  54.24 
 
 		 310 aa  338  9e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636589  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0209  PfkB  53.92 
 
 		 311 aa  334  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3455  PfkB domain protein  52.36 
 
 		 312 aa  333  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04263  sugar kinase  52.54 
 
 		 362 aa  332  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.383154  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  53.58 
 
 		 320 aa  324  9e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  51.55 
 
 		 310 aa  309  4e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2506  ribokinase, putative  55.51 
 
 		 283 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.617052  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  53.69 
 
 		 313 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  53.69 
 
 		 313 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  41.72 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1012  putative carbohydrate kinase  39.93 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0487  ribokinase-like domain-containing protein  40.8 
 
 		 327 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  38.98 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0800  ribokinase-like domain-containing protein  40.13 
 
 		 312 aa  205  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3257  Adenosine kinase  40.47 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00285447  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  38.13 
 
 		 308 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2351  ribokinase-like domain-containing protein  38.1 
 
 		 318 aa  202  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2666  PfkB domain protein  38.59 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3153  Adenosine kinase  39.26 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  37.87 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3081  PfkB domain protein  37.12 
 
 		 324 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  37.67 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12230  carbohydrate kinase cbhK  37.21 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000530804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1286  PfkB domain-containing protein  37.21 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27030  sugar kinase, ribokinase  37.97 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.364358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2947  adenosine kinase  36.79 
 
 		 323 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0955  ribokinase-like domain-containing protein  38.26 
 
 		 339 aa  189  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.989352  normal  0.38603 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3311  adenosine kinase  36.79 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353965  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3063  PfkB domain protein  38.05 
 
 		 324 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142988  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3300  adenosine kinase  36.79 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1665  Adenosine kinase  38.03 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3362  adenosine kinase  36.79 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3566  adenosine kinase  36.82 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0415989  normal  0.0392481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1531  PfkB domain protein  37.91 
 
 		 329 aa  185  9e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3144  ribokinase-like domain-containing protein  37.83 
 
 		 327 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1798  adenosine kinase  38.8 
 
 		 326 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3120  adenosine kinase  37.46 
 
 		 326 aa  179  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3303  ribokinase-like domain-containing protein  36.58 
 
 		 325 aa  178  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.121546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3562  PfkB domain protein  36.49 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4145  PfkB domain-containing protein  36.88 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786211  decreased coverage  0.0063394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3294  PfkB domain protein  35.74 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3535  ribokinase-like domain-containing protein  35.23 
 
 		 325 aa  172  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32323  decreased coverage  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  31.6 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  31.94 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  31.23 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  31.54 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  29.46 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  28.86 
 
 		 299 aa  115  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  28.85 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  30 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  28.91 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  28.45 
 
 		 294 aa  93.6  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  27.5 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  27.72 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  27.72 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  27.72 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0932  inosine-guanosine kinase / cytidine kinase  27.08 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.934328  normal  0.0821037 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  28.52 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  30.07 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  28.42 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>