More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1195 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
316 aa  654    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0047  carbohydrate kinase  66.67 
 
 
310 aa  435  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  62.21 
 
 
310 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2067  Adenosine kinase  61.24 
 
 
310 aa  415  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2548  carbohydrate kinase, PfkB  59.8 
 
 
310 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636589  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  57.23 
 
 
315 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  53.61 
 
 
319 aa  368  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3935  PfkB  55.19 
 
 
310 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0713343  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  55.37 
 
 
311 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  55.16 
 
 
310 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0209  PfkB  53.55 
 
 
311 aa  366  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  54.07 
 
 
311 aa  362  6e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  53.75 
 
 
311 aa  360  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  52.35 
 
 
319 aa  357  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  54.66 
 
 
315 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3455  PfkB domain protein  53.7 
 
 
312 aa  355  5.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327587  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  53.23 
 
 
311 aa  354  8.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  52.61 
 
 
320 aa  354  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2634  ribokinase-like domain-containing protein  54.63 
 
 
314 aa  350  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.831919  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04263  sugar kinase  52.9 
 
 
362 aa  347  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.383154  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  52.23 
 
 
313 aa  347  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  52.23 
 
 
313 aa  347  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  54.34 
 
 
312 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  54.02 
 
 
320 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2945  PfkB domain protein  54.08 
 
 
298 aa  341  8e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3635  ribokinase-like domain-containing protein  53.74 
 
 
298 aa  341  9e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  53.7 
 
 
312 aa  340  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3683  adenosine kinase  51.13 
 
 
312 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235022  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  51.77 
 
 
312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0386  ribokinase-like domain-containing protein  56.08 
 
 
302 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1493  ribokinase-like domain-containing protein  53.06 
 
 
298 aa  332  6e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  51.77 
 
 
312 aa  331  8e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0117  adenosine kinase  49.52 
 
 
312 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0569  ribokinase-like domain-containing protein  49.52 
 
 
312 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  decreased coverage  0.0000690864 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0600  adenosine kinase  49.52 
 
 
312 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3506  sugar kinase  50 
 
 
312 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3470  PfkB family kinase  50 
 
 
312 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3508  PfkB family kinase  50 
 
 
312 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1158  ribokinase, putative  50 
 
 
312 aa  324  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1103  PfkB  52.19 
 
 
300 aa  324  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00948504  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1286  putative ribokinase  49.68 
 
 
312 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3278  putative ribokinase  49.68 
 
 
312 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0427  putative ribokinase  49.68 
 
 
312 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0861  ribokinase-like domain-containing protein  50.34 
 
 
298 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.035179  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3388  ribokinase-like domain-containing protein  50.33 
 
 
307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.684995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0953  PfkB domain protein  49.33 
 
 
300 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3210  putative sugar kinase transferase protein  51.19 
 
 
301 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258809  decreased coverage  0.003878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1498  ribokinase-like domain-containing protein  49.66 
 
 
300 aa  309  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2506  ribokinase, putative  48.4 
 
 
283 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.617052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2351  ribokinase-like domain-containing protein  42.53 
 
 
318 aa  262  6e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0487  ribokinase-like domain-containing protein  40.76 
 
 
327 aa  258  7e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  41.14 
 
 
327 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3562  PfkB domain protein  39.94 
 
 
324 aa  257  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  43.23 
 
 
308 aa  246  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  42.39 
 
 
308 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  39.81 
 
 
318 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0800  ribokinase-like domain-containing protein  41.21 
 
 
312 aa  242  7e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  40.76 
 
 
308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1286  PfkB domain-containing protein  37.46 
 
 
328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3081  PfkB domain protein  35.67 
 
 
324 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2666  PfkB domain protein  36.81 
 
 
328 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1012  putative carbohydrate kinase  35.58 
 
 
324 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27030  sugar kinase, ribokinase  35.39 
 
 
321 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.364358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3120  adenosine kinase  35.78 
 
 
326 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12230  carbohydrate kinase cbhK  35.9 
 
 
324 aa  202  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000530804  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3063  PfkB domain protein  33.97 
 
 
324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142988  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1531  PfkB domain protein  35.89 
 
 
329 aa  199  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0955  ribokinase-like domain-containing protein  35.29 
 
 
339 aa  199  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.989352  normal  0.38603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3257  Adenosine kinase  35.9 
 
 
325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00285447  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3294  PfkB domain protein  35.14 
 
 
325 aa  196  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3153  Adenosine kinase  33.64 
 
 
323 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1798  adenosine kinase  33.97 
 
 
326 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1665  Adenosine kinase  32.18 
 
 
329 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2947  adenosine kinase  33.33 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3144  ribokinase-like domain-containing protein  33.97 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4145  PfkB domain-containing protein  32.81 
 
 
327 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786211  decreased coverage  0.0063394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3311  adenosine kinase  32.27 
 
 
324 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353965  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3300  adenosine kinase  32.27 
 
 
324 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3362  adenosine kinase  32.27 
 
 
324 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3535  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
325 aa  182  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32323  decreased coverage  0.000219352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3566  adenosine kinase  31.73 
 
 
323 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0415989  normal  0.0392481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3303  ribokinase-like domain-containing protein  32.69 
 
 
325 aa  178  9e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121546 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  31.71 
 
 
302 aa  142  5e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  31.01 
 
 
302 aa  142  8e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  31.71 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  30.79 
 
 
298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  30.66 
 
 
302 aa  139  6e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  30.5 
 
 
300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  31.46 
 
 
299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  28.83 
 
 
317 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  28.99 
 
 
299 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  30.4 
 
 
296 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  28.8 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0932  inosine-guanosine kinase / cytidine kinase  26.8 
 
 
298 aa  87.4  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.934328  normal  0.0821037 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1658  ribokinase-like domain-containing protein  27.09 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.468132  normal  0.0440332 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  27.17 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  25.69 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  39.36 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  23.99 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  27.67 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>