More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1658 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1658  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  620  1e-176  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.468132  normal  0.0440332 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  59.73 
 
 		 299 aa  360  1e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  63.01 
 
 		 294 aa  355  6.999999999999999e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  60.07 
 
 		 296 aa  330  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  47.6 
 
 		 300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0932  inosine-guanosine kinase / cytidine kinase  47.78 
 
 		 298 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.934328  normal  0.0821037 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  43.34 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  40.96 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  40.61 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  40.27 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  39.59 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  39.38 
 
 		 298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2351  ribokinase-like domain-containing protein  32.45 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153207  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3935  PfkB  31.7 
 
 		 310 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0713343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  33.12 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0800  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  30 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2067  Adenosine kinase  30.34 
 
 		 310 aa  119  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0209  PfkB  30.03 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  29.82 
 
 		 310 aa  115  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  32.48 
 
 		 308 aa  115  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  31.27 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1286  PfkB domain-containing protein  30.29 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2666  PfkB domain protein  31.27 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  30.61 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  30.61 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0487  ribokinase-like domain-containing protein  33.09 
 
 		 327 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0047  carbohydrate kinase  28.22 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3455  PfkB domain protein  28.62 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  27.68 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  29.79 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3562  PfkB domain protein  29.52 
 
 		 324 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  29.73 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2634  ribokinase-like domain-containing protein  27.21 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.831919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  28.42 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1493  ribokinase-like domain-containing protein  30.65 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1012  putative carbohydrate kinase  29.17 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2548  carbohydrate kinase, PfkB  27.52 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636589  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3144  ribokinase-like domain-containing protein  28.3 
 
 		 327 aa  98.2  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3278  putative ribokinase  27.78 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0427  putative ribokinase  27.78 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1286  putative ribokinase  27.78 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2506  ribokinase, putative  28.68 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.617052  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3470  PfkB family kinase  27.45 
 
 		 312 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3506  sugar kinase  27.45 
 
 		 312 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3508  PfkB family kinase  27.45 
 
 		 312 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1158  ribokinase, putative  27.12 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  28.87 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3081  PfkB domain protein  28.62 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  29.31 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3683  adenosine kinase  27.43 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4145  PfkB domain-containing protein  27.56 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786211  decreased coverage  0.0063394 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3063  PfkB domain protein  29.11 
 
 		 324 aa  92.8  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142988  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3294  PfkB domain protein  31.25 
 
 		 325 aa  92.8  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  27.11 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  28.52 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  26.56 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  26.89 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  27.65 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0955  ribokinase-like domain-containing protein  31.91 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.989352  normal  0.38603 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  24.92 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3535  ribokinase-like domain-containing protein  26.6 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32323  decreased coverage  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1798  adenosine kinase  26.92 
 
 		 326 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  26.56 
 
 		 320 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04263  sugar kinase  26.9 
 
 		 362 aa  89.4  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.383154  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3153  Adenosine kinase  27.88 
 
 		 323 aa  89.4  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1103  PfkB  27.84 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00948504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1498  ribokinase-like domain-containing protein  27.63 
 
 		 300 aa  89  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3120  adenosine kinase  26.84 
 
 		 326 aa  89  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  27.6 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0117  adenosine kinase  26.39 
 
 		 312 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0600  adenosine kinase  26.39 
 
 		 312 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0569  ribokinase-like domain-containing protein  26.39 
 
 		 312 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  decreased coverage  0.0000690864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  28.33 
 
 		 320 aa  86.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0480  PfkB domain protein  24.65 
 
 		 275 aa  86.7  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3303  ribokinase-like domain-containing protein  25.96 
 
 		 325 aa  86.3  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.121546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2945  PfkB domain protein  26.21 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  26.16 
 
 		 319 aa  86.3  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  26.94 
 
 		 308 aa  86.3  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3388  ribokinase-like domain-containing protein  27.71 
 
 		 307 aa  85.9  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.684995 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3635  ribokinase-like domain-containing protein  26.21 
 
 		 298 aa  85.9  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  24.59 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27030  sugar kinase, ribokinase  28.12 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.364358 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  27.7 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1531  PfkB domain protein  27.81 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  24.83 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  25.68 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3257  Adenosine kinase  27.7 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00285447  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  28.41 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3311  adenosine kinase  27.89 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353965  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  23.53 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3300  adenosine kinase  27.89 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3362  adenosine kinase  27.89 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0861  ribokinase-like domain-containing protein  26.61 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.035179  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1665  Adenosine kinase  24.29 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3210  putative sugar kinase transferase protein  26.1 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258809  decreased coverage  0.003878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  28.33 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  25.08 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  23.18 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>