218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1531 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1531  PfkB domain protein  100 
 
 
329 aa  660    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3063  PfkB domain protein  62.61 
 
 
324 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142988  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3300  adenosine kinase  61.09 
 
 
324 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3362  adenosine kinase  61.09 
 
 
324 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3311  adenosine kinase  61.09 
 
 
324 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353965  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2947  adenosine kinase  60.49 
 
 
323 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3566  adenosine kinase  60.69 
 
 
323 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0415989  normal  0.0392481 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12230  carbohydrate kinase cbhK  61.4 
 
 
324 aa  395  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000530804  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3120  adenosine kinase  59.08 
 
 
326 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3081  PfkB domain protein  56.23 
 
 
324 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4145  PfkB domain-containing protein  55.93 
 
 
327 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786211  decreased coverage  0.0063394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3535  ribokinase-like domain-containing protein  58.77 
 
 
325 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32323  decreased coverage  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3303  ribokinase-like domain-containing protein  58.77 
 
 
325 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1798  adenosine kinase  57.45 
 
 
326 aa  357  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3153  Adenosine kinase  57.23 
 
 
323 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1665  Adenosine kinase  55.02 
 
 
329 aa  355  6.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1012  putative carbohydrate kinase  56.92 
 
 
324 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27030  sugar kinase, ribokinase  56.62 
 
 
321 aa  353  2.9999999999999997e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.364358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1286  PfkB domain-containing protein  57.19 
 
 
328 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3257  Adenosine kinase  57.5 
 
 
325 aa  345  5e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00285447  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2666  PfkB domain protein  56.87 
 
 
328 aa  340  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3144  ribokinase-like domain-containing protein  51.06 
 
 
327 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0955  ribokinase-like domain-containing protein  52.88 
 
 
339 aa  316  4e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.989352  normal  0.38603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3294  PfkB domain protein  53.19 
 
 
325 aa  315  7e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2351  ribokinase-like domain-containing protein  38.01 
 
 
318 aa  208  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153207  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  35.89 
 
 
316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3562  PfkB domain protein  33.94 
 
 
324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  36.53 
 
 
319 aa  195  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  36.22 
 
 
319 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  34.81 
 
 
327 aa  192  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  34.47 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0487  ribokinase-like domain-containing protein  34.18 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3635  ribokinase-like domain-containing protein  37.91 
 
 
298 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2945  PfkB domain protein  37.91 
 
 
298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  36.33 
 
 
318 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  34.58 
 
 
320 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3455  PfkB domain protein  32.31 
 
 
312 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327587  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  33.86 
 
 
311 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  32.3 
 
 
315 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  33.86 
 
 
311 aa  176  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  33.86 
 
 
311 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1103  PfkB  37.09 
 
 
300 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00948504  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1493  ribokinase-like domain-containing protein  35.74 
 
 
298 aa  176  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2548  carbohydrate kinase, PfkB  31.55 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636589  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  34.58 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3388  ribokinase-like domain-containing protein  36.04 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.684995 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  31.76 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2634  ribokinase-like domain-containing protein  33.96 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.831919  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  33.96 
 
 
312 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0047  carbohydrate kinase  33.33 
 
 
310 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
312 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04263  sugar kinase  31.56 
 
 
362 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.383154  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0117  adenosine kinase  33.96 
 
 
312 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
320 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0600  adenosine kinase  33.96 
 
 
312 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0569  ribokinase-like domain-containing protein  33.96 
 
 
312 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  decreased coverage  0.0000690864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1498  ribokinase-like domain-containing protein  36.66 
 
 
300 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2067  Adenosine kinase  30.82 
 
 
310 aa  168  9e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0386  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 
302 aa  169  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477103 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0209  PfkB  32.92 
 
 
311 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3683  adenosine kinase  33.96 
 
 
312 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235022  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1158  ribokinase, putative  32.39 
 
 
312 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3210  putative sugar kinase transferase protein  35.5 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258809  decreased coverage  0.003878 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  33.02 
 
 
312 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3506  sugar kinase  32.39 
 
 
312 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3470  PfkB family kinase  32.39 
 
 
312 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3508  PfkB family kinase  32.39 
 
 
312 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0427  putative ribokinase  32.39 
 
 
312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1286  putative ribokinase  32.39 
 
 
312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3278  putative ribokinase  32.39 
 
 
312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  34.89 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  32.39 
 
 
308 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0861  ribokinase-like domain-containing protein  35.48 
 
 
298 aa  162  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.035179  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  32.71 
 
 
310 aa  159  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  31.15 
 
 
313 aa  156  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0953  PfkB domain protein  32.46 
 
 
300 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  31.15 
 
 
313 aa  156  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3935  PfkB  30.41 
 
 
310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0713343  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  32.7 
 
 
308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  31.35 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0800  ribokinase-like domain-containing protein  30.5 
 
 
312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2506  ribokinase, putative  31.47 
 
 
283 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.617052  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  27.71 
 
 
302 aa  116  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  28.84 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  28.25 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  28.52 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.62 
 
 
302 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  33.08 
 
 
300 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  28.44 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  29.3 
 
 
299 aa  93.6  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  26.46 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  28.75 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  27.69 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0932  inosine-guanosine kinase / cytidine kinase  27.86 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.934328  normal  0.0821037 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  31.4 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  28.68 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  28.31 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  32.58 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1658  ribokinase-like domain-containing protein  27.76 
 
 
298 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.468132  normal  0.0440332 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  28.28 
 
 
310 aa  63.2  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>