More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0551 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  100 
 
 
306 aa  593  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  97.39 
 
 
306 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  55.63 
 
 
303 aa  353  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  55.3 
 
 
303 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  55.3 
 
 
303 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  55.3 
 
 
303 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  54.97 
 
 
303 aa  352  5e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  54.97 
 
 
303 aa  349  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  54.97 
 
 
303 aa  349  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  54.97 
 
 
303 aa  348  6e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  54.97 
 
 
303 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  53.31 
 
 
303 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  53.31 
 
 
303 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  50 
 
 
303 aa  301  8.000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  49.34 
 
 
303 aa  293  3e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  48.34 
 
 
303 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  45.21 
 
 
304 aa  290  1e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  48.51 
 
 
303 aa  288  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  49.34 
 
 
300 aa  276  4e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  44.92 
 
 
302 aa  267  1e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  44.41 
 
 
305 aa  263  2e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  45.39 
 
 
308 aa  261  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  43.54 
 
 
306 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  43.54 
 
 
306 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  41.5 
 
 
306 aa  256  5e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  44.41 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  45.54 
 
 
307 aa  248  1e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0435  1-phosphofructokinase  42.21 
 
 
310 aa  243  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  46.38 
 
 
302 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0599  1-phosphofructokinase  40.6 
 
 
338 aa  230  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0298214  normal  0.491276 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  41.91 
 
 
304 aa  223  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13290  1-phosphofructokinase  39.87 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0619  1-phosphofructokinase  36.82 
 
 
313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.502151  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  34.31 
 
 
324 aa  199  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  43.63 
 
 
310 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0852  1-phosphofructokinase, putative  40.19 
 
 
311 aa  191  1e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.810869  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  37.42 
 
 
310 aa  189  5e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  36.07 
 
 
308 aa  189  7e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  37.74 
 
 
310 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  37.42 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0148  fructose-1-phosphate kinase-like protein  39.78 
 
 
308 aa  182  6e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000234171 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  36.21 
 
 
306 aa  175  7e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  33.23 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  34.52 
 
 
307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1965  1-phosphofructokinase  33.88 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.261569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  32.9 
 
 
307 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl180  1-phosphofructokinase  39.87 
 
 
311 aa  170  3e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  34.5 
 
 
315 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  34.11 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  37.21 
 
 
315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  33.01 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  35.79 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  33.33 
 
 
310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  34.11 
 
 
314 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  35.09 
 
 
313 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 
318 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  33.58 
 
 
318 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  35.76 
 
 
318 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  34.03 
 
 
326 aa  158  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  32.95 
 
 
315 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  33.33 
 
 
315 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  34.75 
 
 
308 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  31.89 
 
 
318 aa  156  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  37.34 
 
 
308 aa  155  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  35.63 
 
 
316 aa  155  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  31.32 
 
 
316 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  31.72 
 
 
309 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  31.37 
 
 
320 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  33.46 
 
 
308 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  36.92 
 
 
336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  36.68 
 
 
310 aa  153  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0322  1-phosphofructokinase  30.62 
 
 
305 aa  153  4e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000799963  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  35.82 
 
 
310 aa  152  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  32.56 
 
 
315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0824  1-phosphofructokinase  31.42 
 
 
310 aa  152  7e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  34.06 
 
 
325 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  32.26 
 
 
311 aa  151  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  31.82 
 
 
313 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  33.2 
 
 
312 aa  150  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  33.82 
 
 
330 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  31.88 
 
 
313 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  32.05 
 
 
311 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1735  1-phosphofructokinase  37.16 
 
 
313 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  32.45 
 
 
318 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0676  ribokinase-like domain-containing protein  30.7 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  35.91 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  35.91 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  30.47 
 
 
312 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  32.56 
 
 
313 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  33.59 
 
 
325 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  30.45 
 
 
311 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  29.93 
 
 
313 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  33.46 
 
 
312 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  31.18 
 
 
306 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  32.68 
 
 
313 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  31.43 
 
 
311 aa  142  9e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  32.7 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2297  1-phosphofructokinase  31.89 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  28.25 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  29.6 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>