More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4226 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 313 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  59.68 
 
 		 328 aa  332  6e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  54.81 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  52.22 
 
 		 315 aa  272  5.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  48.65 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  53.82 
 
 		 308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  52.53 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  48.22 
 
 		 321 aa  218  8.999999999999998e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  45.4 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  43.17 
 
 		 336 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  45.6 
 
 		 316 aa  208  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  47.12 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  44.44 
 
 		 318 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  45.03 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  43.67 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0300  ribokinase-like domain-containing protein  45.62 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0081  PfkB  43.4 
 
 		 325 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0457404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0090  ribokinase-like domain-containing protein  43.4 
 
 		 325 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0071  ribokinase-like domain-containing protein  43.4 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.897309  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4851  1-phosphofructokinase  45.25 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440594  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0185  1-phosphofructokinase  49.35 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22310  1-phosphofructokinase  42.17 
 
 		 318 aa  169  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0526  1-phosphofructokinase  45.48 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  35.33 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  33.21 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  37.79 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  37.75 
 
 		 310 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  36.67 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  34.78 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  37.42 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  37.12 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  39.8 
 
 		 350 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  34.98 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  37.42 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  36.91 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  33.57 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  33 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  32.86 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  32.86 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  32.86 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  32.86 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  33.8 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  35.02 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  32.86 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  33.11 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  36.21 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  34.86 
 
 		 307 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  32.5 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  37.79 
 
 		 312 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  33.21 
 
 		 303 aa  142  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  37.12 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  36.24 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  32.11 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1394  ribokinase-like domain-containing protein  38.8 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224009  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  32.5 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  32.86 
 
 		 303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  29.93 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  32.44 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1791  ribokinase-like domain-containing protein  38.11 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.176748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  35.57 
 
 		 309 aa  139  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  35.57 
 
 		 309 aa  139  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  35.57 
 
 		 309 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  35.57 
 
 		 309 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  35.57 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  35.57 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  35.57 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  35.57 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  29.93 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  35.23 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  32.89 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  37.46 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  36.79 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  35.88 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  38.46 
 
 		 320 aa  136  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  34.54 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  30.99 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  34.22 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  35.39 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  39.56 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  29.58 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  28.52 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  32.11 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  36.51 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  31.67 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  36.46 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  31.67 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  36.45 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1282  6-phosphofructokinase  40.53 
 
 		 319 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0117  6-phosphofructokinase  40.53 
 
 		 313 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425827  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4987  ribokinase-like domain-containing protein  36.98 
 
 		 315 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0142  6-phosphofructokinase  40.53 
 
 		 449 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  40.53 
 
 		 442 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  34.6 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2801  6-phosphofructokinase  40.53 
 
 		 442 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  33.09 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  31.99 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  34.56 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  36.45 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  36.45 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  37.27 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>