293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0185 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0185  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 323 aa  610  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  56.92 
 
 		 321 aa  279  6e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  54.55 
 
 		 325 aa  268  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  52.98 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0081  PfkB  57.47 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0457404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0090  ribokinase-like domain-containing protein  57.47 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0071  ribokinase-like domain-containing protein  57.47 
 
 		 325 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.897309  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  52.35 
 
 		 318 aa  251  9.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22310  1-phosphofructokinase  50.32 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4851  1-phosphofructokinase  51.41 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  50.65 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0300  ribokinase-like domain-containing protein  49.69 
 
 		 332 aa  199  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  50.64 
 
 		 308 aa  199  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0526  1-phosphofructokinase  48.1 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  46.37 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  42.81 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  42.9 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  44.76 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  43.61 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  45.05 
 
 		 315 aa  172  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  43.03 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  45.85 
 
 		 319 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  46.86 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  31.65 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  34.75 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  36.22 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  35.08 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  40.32 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  38.22 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 		 319 aa  125  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  34.55 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  29.8 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  34.94 
 
 		 312 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  30.79 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  29.45 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  29.43 
 
 		 324 aa  122  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  34.97 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  33.02 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  40.2 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  37 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  37 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  36.01 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  37 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  30.62 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  35.13 
 
 		 322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  28.57 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  37.46 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  31.82 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  34.97 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5797  PfkB domain protein  37.82 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  39.58 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  28.9 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5907  1-phosphofructokinase  36.84 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686402  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  38.82 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  31.82 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  34.47 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  34.47 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  37.11 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  34.13 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  34.47 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  34.13 
 
 		 303 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  31.02 
 
 		 309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  34.47 
 
 		 303 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  38.1 
 
 		 318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  32.33 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  35.26 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  38.52 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  35.52 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  28.57 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  33.87 
 
 		 314 aa  113  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0209  1-phosphofructokinase  33.88 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  35.19 
 
 		 306 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  35.53 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  32.76 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  33.66 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  33.99 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  33.66 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  33.99 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  33.99 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  35.31 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  33.99 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  35.31 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  33.66 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  33.66 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  33.99 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  35.31 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  31.48 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  30.41 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  34.77 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12066  phosphofructokinase pfkB  35.39 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  34.88 
 
 		 319 aa  109  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  34.88 
 
 		 319 aa  109  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  33.11 
 
 		 303 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  31.42 
 
 		 303 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  29.51 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  34.74 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  34.92 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  31.42 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>