More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3475 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  100 
 
 
324 aa  645    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  100 
 
 
324 aa  645    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  100 
 
 
324 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12066  phosphofructokinase pfkB  66.88 
 
 
339 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1394  ribokinase-like domain-containing protein  60.8 
 
 
314 aa  348  8e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224009  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  57.83 
 
 
332 aa  342  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4987  ribokinase-like domain-containing protein  59.47 
 
 
315 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  47.02 
 
 
312 aa  265  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  42.86 
 
 
311 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  43.23 
 
 
311 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  42.19 
 
 
311 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  46 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  46 
 
 
312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  45.85 
 
 
312 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  44.59 
 
 
319 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  46.45 
 
 
320 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  42.63 
 
 
350 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  46.33 
 
 
312 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  45 
 
 
312 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  41.91 
 
 
332 aa  229  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  41.2 
 
 
311 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  41.86 
 
 
326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  41.72 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  41.72 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  41.72 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  40.4 
 
 
309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  40.4 
 
 
309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  41.39 
 
 
310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  40.4 
 
 
309 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  40.4 
 
 
309 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  40.4 
 
 
309 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  40.4 
 
 
309 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  40.4 
 
 
309 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  40.4 
 
 
309 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  40.4 
 
 
309 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  40.73 
 
 
310 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1282  6-phosphofructokinase  42.67 
 
 
319 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0142  6-phosphofructokinase  42.67 
 
 
449 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2801  6-phosphofructokinase  42.67 
 
 
442 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0882  ribokinase-like domain-containing protein  42.16 
 
 
319 aa  208  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00379836  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  42.67 
 
 
442 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  39.93 
 
 
310 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1061  6-phosphofructokinase  42.35 
 
 
473 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0117  6-phosphofructokinase  42.35 
 
 
313 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425827  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  38.82 
 
 
310 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  38.82 
 
 
310 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  38.87 
 
 
322 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1621  putative 6-phosphofructokinase isozyme 2  39.14 
 
 
316 aa  189  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6479  6-phosphofructokinase  42.52 
 
 
312 aa  189  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1098  1-phosphofructokinase  37.17 
 
 
334 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424863  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2334  6-phosphofructokinase  39.8 
 
 
314 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1009  ribokinase-like domain-containing protein  39.8 
 
 
314 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1592  ribokinase-like domain-containing protein  38.91 
 
 
314 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  34.78 
 
 
310 aa  162  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  34.11 
 
 
310 aa  159  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  33.89 
 
 
310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  32.12 
 
 
309 aa  146  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  35.5 
 
 
325 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 
312 aa  142  6e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  28.24 
 
 
307 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  32.79 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  31.27 
 
 
311 aa  139  6e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  28.57 
 
 
307 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  31.45 
 
 
318 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  32.69 
 
 
319 aa  136  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  32.69 
 
 
319 aa  136  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  30.79 
 
 
315 aa  136  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  30.26 
 
 
306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  29.84 
 
 
311 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  32.09 
 
 
306 aa  134  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  31.7 
 
 
316 aa  134  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  31.43 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  30.03 
 
 
310 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  36.45 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  30.5 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  31.15 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  32.33 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  35.79 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  32.48 
 
 
320 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  29.9 
 
 
303 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  34.56 
 
 
308 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  30.56 
 
 
303 aa  126  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  29.9 
 
 
303 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  30.13 
 
 
303 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  30.13 
 
 
303 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  30.13 
 
 
303 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  30.13 
 
 
303 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  29.18 
 
 
311 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  30.13 
 
 
303 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  35 
 
 
333 aa  122  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  29.57 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  30.13 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  29.41 
 
 
304 aa  119  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  35.05 
 
 
308 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  34.34 
 
 
315 aa  117  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  34 
 
 
318 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  34.69 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  34.31 
 
 
312 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  34.29 
 
 
317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  34.21 
 
 
318 aa  113  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>