More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5272 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 325 aa  624  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  55.45 
 
 		 316 aa  288  6e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  51.67 
 
 		 336 aa  275  9e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  53.42 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  47.08 
 
 		 333 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  48.72 
 
 		 319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  48.22 
 
 		 308 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  45.4 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  43.91 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  42.49 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  43.21 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  44.23 
 
 		 328 aa  199  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  43.83 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  42.68 
 
 		 321 aa  192  9e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0081  PfkB  44.44 
 
 		 325 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0457404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0090  ribokinase-like domain-containing protein  44.44 
 
 		 325 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0071  ribokinase-like domain-containing protein  44.44 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.897309  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  43.57 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4851  1-phosphofructokinase  43.08 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440594  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0300  ribokinase-like domain-containing protein  42.26 
 
 		 332 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0185  1-phosphofructokinase  41.88 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  35.23 
 
 		 315 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  36.07 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0526  1-phosphofructokinase  39.34 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  34.64 
 
 		 319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  31.85 
 
 		 310 aa  155  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  35.64 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  35.5 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  32.08 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  35 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  34.67 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  34.67 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  34.67 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  34.31 
 
 		 303 aa  153  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  38.89 
 
 		 314 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  41.54 
 
 		 318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  34.93 
 
 		 306 aa  152  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  34.74 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  40.14 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  37.58 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  40.07 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  34.31 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  34.31 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  35.4 
 
 		 304 aa  150  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  37.99 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  37.99 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  33.94 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  34.31 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  37.99 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  37.99 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  32.28 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  37.66 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  37.66 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  38.83 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  37.99 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  35.24 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  36.6 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  34.31 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  36.96 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  36.96 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  30.42 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  37.34 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  37.34 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  36.6 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  34.73 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  35.26 
 
 		 312 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  33.01 
 
 		 310 aa  146  6e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  41.22 
 
 		 327 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  35.42 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  35.5 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  35.5 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  32.85 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  35.5 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  36.69 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  34.07 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22310  1-phosphofructokinase  38.65 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  32.79 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  34.84 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  32.45 
 
 		 313 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  36.33 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  35.79 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  34.89 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  39.26 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  31.94 
 
 		 311 aa  142  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  36.33 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  36.33 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  36.51 
 
 		 312 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  36.33 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  35.14 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  37.06 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0824  1-phosphofructokinase  35.14 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  30.9 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  32.13 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  39.87 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  33.7 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  36.01 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0661  1-phosphofructokinase  38.85 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0132953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1282  6-phosphofructokinase  40.94 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  40.94 
 
 		 442 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  34.06 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>